一场原本热热闹闹的社区游行活动出现可怕的情况，引发了家庭矛盾和政治矛盾。与此同时，Maura也在经历自己的家庭危机，她的行为变得有些出格。副总警监CaseyJones意外来访，透露了一些令人震惊的消息。

一名过分热心的新闻专业学生被人谋杀，Jane和Maura展开调查。Jane以前的一名同事（AmauryNolasco）已经返回城中担任禁毒组的新负责人，Jane很不情愿再见到他。但是怕什么来什么……Jane不仅在工作中要和他合作，还被迫回忆起当年毁掉他们关系的「灾难时刻」。与此同时，Cailin（EmileeWallace）提供的一条警示信息驱使Maura对Hope（SharonLawrence）展开调查。

TJ在教堂接受洗礼仪式，然而一具尸体的出现让神圣的仪式变成了一场恶梦。Lydia的未婚夫StuartStawbridge（JarebDauplaise）威胁要夺走TJ的监护权，Jane差点滥用职权来保护Tommy。与此同时，警署面临削减资金预算的压力，每个人都感到紧张。

Maura的新约会对象被人谋杀，Maura成了头号嫌疑人。更糟的是，她完全记不清当天晚上两人在一起时发生过什么事情！针对Maura的不利证据越来越多，Jane竭力保护自己的好友，但是又不能违背作为一个警察的职责。在这一集中我们看到，Maura穿上橙色的囚衣被关进了看守所，而且受到其他女犯人的欺负……Maura这种娇小姐要如何逃过此劫呢？

在Paddy（JohnDoman）谋杀案庭审的第一天，Maura通过Hope（SharonLawrence）对父亲有了更多了解。Korsak说出了Cavanaugh的悲惨过去。一系列出人意料的情况令Maura和Jane发现了Paddy和Hope的一个大秘密，这个秘密对他们所有人都有影响，因此Maura和Jane必须尽快选择阵营。

Jane在「BostonJoe」餐馆将热咖啡泼洒到一个陌生人身上，关于她的「病毒视频」很快在互联网上流传开来——这不仅会影响她的名声，还会危及她的事业。与此同时，调查组全力侦破与一名阴谋论者有关的奇异谋杀案。

一个受人欢迎的高中教师死于交通肇事逃逸事故，但这显然是一起谋杀案。当调查组开始侦办此案时，Jane却无法将注意力集中在案情上——Martinez警官（AmauryNolasco）明显偏爱他自己的禁毒组，根本没把Jane的团队当回事，这让Jane很不高兴！

一起可怕的谋杀案涉及一位年轻的冰球联盟球员，调查组邀请小Frankie帮忙进行调查。Cailin（EmileeWallace）对Hope（SharonLawrence）非常不满，愤然搬来和Maura一起住。Maura很快发现家里有个年轻人是一件很麻烦的事情……那需要她掌握她并不拥有的「技能」！

Jane和Maura应邀前往一个执法队伍学术研讨报告会上介绍连环杀手CharlesHoyt案的有关细节，但Jane担心自己无法面对一些可怕的回忆。Jane和Maura开始模拟Hoyt谋杀案的调查过程，然而她们很快有了一个令人感到恐惧的发现。不久之后，Jane、Maura和她们的调查组卷入了一场致命的猫鼠游戏，一个新的、更加可怕的连环杀手潜伏在暗处伺机展开行动。

一场午夜业余汽车加速赛发生严重的爆炸事件，警方赶到现场进行调查。随着新证据的不断出现，Jane怀疑这起案件可能涉及毒品走私，于是向Martinez警官求援。然而Martinez不但不帮助她，反而还妨碍了她的调查行动。

一名模拟审判顾问（A’daAlisonWoolfolk）在一场竞争中离奇死亡。与此同时，Angela对于卖巧克力糕饼的兴趣越来越浓，Jane不禁担心Angela隐瞒了自己的「经济危机」。Tommy（ColinEgglesfield）雇佣一个律师（ChrisCoppola）来清算自己与Storrow中心的债务并解决索赔问题。

在夏季最后一集中，调查组在侦查一起暴力谋杀案时发现证据相互矛盾。Maura为一个重大人生抉择而忧心忡忡——她是否应该将最近刚刚获得假释的爷爷（RichardHerd）接到家中来住？与此同时，Jane和Casey被迫在他们的职业生涯和个人爱情之间做出选择。

一名将自己打扮成小丑的绑匪潜伏20多年后重出江湖，警方担心他会给波士顿造成重大伤害。为了尽快获得有关线索，警方翻出当年未能侦破的绑架案的卷宗——1988年，这个犯罪分子制造了轰动一时的「小丑之夏」（SummerOfTheClown）事件。与此同时，Jane和Casey的关系走到了十字路口。如果他们真的决定结婚，那么他们当中必须有一人做出事业上的牺牲。Maura也面临自己的困境：她无意中卷入了另一场爱情关系！本剧的常规演员LeeThompsonYoung在去年八月不幸去世，但他会继续在本季剩余部分中亮相——不是他死而复生了，而是他在死之前已经拍完了许多镜头。

一位歌手兼吉他乐手在一家酒吧里被人残忍地捅伤，凶手的作案手法和作案动机都很神秘。警方在调查中发现，受害人隐瞒了一些重要的事情。与此同时，Jane的父亲（ChazPalminteri）在离开一年后回到城中，他带回来令人震惊的消息。

一名餐车大厨突然死亡，所有证据都显示他死于中毒，但是警方仍然面对一大堆亟待破解的疑团。与此同时，Tommy宣布了一件大事，令Angela感到非常兴奋。Maura的亲生母亲Hope（SharonLawrence）为了和女儿缓和矛盾而采取一项大胆的行动。

某参议员的女儿遭谋杀，美国国家安全局介入调查。警方必须抢时间侦破这起谋杀案，但那却危及所谓的「国家安全」。与此同时，Tommy（ColinEgglesfield）重拾以前的坏习惯，Frankie和他发生激烈争吵。Jane透露了一些令人震惊的消息，她的人生可能被彻底改变。