华安市研究所研究人员楚闻怀与助手茹曼，研究的治疗SK病的实验在最后时刻宣告失败，黑社会头目、王朝酒店老总苗旭以挟持楚闻怀的妻子和儿子要挟楚闻怀，继续研究该成果并将成果交给他。国外经济考察团即将来华安市考察，这个考察团不但有跨国公司总裁，还有一些国家的高级经济顾问。为了确保这个考察团的安全，华安市公安部门成了一个特别警务小组，省公安厅决定将公安系统的炸弹专家调来。作为组员的肖世杰带着六岁的儿子肖冰来到华安市，在闹市区肖世杰抓住了一个小偷，与研究所的研究人员茹曼相识。而肖世杰的个性和处事方式，却为华安市公安局局长许智建所不满。楚闻怀的侄子楚明因勒索楚闻怀所得的设备回扣款，被苗旭的手下陶大壮绞死抛尸海里。尸体被发现后，肖世杰配合华安市警方的刑警纪正龙投入到了这起命案的侦查。与此同时，境外恐怖组织成

肖世杰将楚明被杀与茹曼遇刺的案子连在一起，将茹曼叫到公安局询问，受到许智建的质疑，许智建命令肖世杰，以后所有行动，要向他汇报……境外黑势力成员安柯为了拿到SK的某些元素，制造成病毒，投放到国外考察团的会场，以炸楼相威胁，与苗旭达成协议：由安柯刺杀茹曼，苗旭提供SK元素……苗旭为了得到在华安市建跨海大桥的项目，将其他投标人请到浴都，软硬兼施，迫使其他投标人自动退出。沈依萍约见肖世杰，两人对过去的分手很是留恋，沈依萍非常同情肖世杰带孩子的辛苦，但所有的已成过去，沈依萍向肖世杰透露出想在国内投资的意向。茹曼已经受到警方的严密保护，这天晚上，一直恋着柴笑天的茹曼，看到了柴笑天喝醉酒被白小妍送回家并关上了卧室的灯，茹曼绝望地离去。

肖世杰再次救下了身处险境的茹曼。获救的茹曼跟随肖世杰来到公安部门提供的庇护所，在这里，看到肖世杰和儿子相依为命的情形，茹曼的心被震动了。同样缅怀往昔情感的肖世杰同意沈依萍看望儿子，儿子肖冰却不愿意认这个妈妈。安柯接到上级指令，暂时放弃对茹曼的行动。肖世杰和纪正龙找楚闻怀了解研究所的研究项目，楚闻怀向两人保证决不出卖国家利益。之后楚闻怀再次遭到犯罪分子的胁迫和恐吓，走投无路之下服毒身亡。肖世杰将这个消息汇报给了许智建。

研究所相继的两起命案引起轩然大波，肖世杰更加坚定地认为茹曼隐瞒了什么。他的质疑和有条理的分析得到了许智建的赞同。楚闻怀死后苗旭和安柯再次把目标选中茹曼。在肖世杰询问下，茹曼将有人曾想从楚闻怀手中购买试验配方的事告诉给了肖世杰。相处中，茹曼对肖世杰和肖冰慢慢有了感情。而苗旭的公司内部，他的手下兼情人白小妍，开始为自己的私欲背叛和算计苗旭，和柴笑天达成了协议……

楚闻怀死后，苗旭将目光移向了茹曼。白小妍将雇佣的电脑专家灭口，临死前，电脑专家将获取的一些资料，同时发送给公安局和苗旭本人。沈依萍约安柯见面，一直和安柯通过电子邮件联系的上级浮出水面。肖世杰根据电子邮件地址找到电脑专家的住址，结果已经是人去楼空。苗旭的情况开始引起了肖世杰的注意，但因苗旭的特殊身份，许智建要肖世杰以其他渠道接触苗旭，不得采用强硬手段。恰在这时，沈依萍以给苗旭投资共同开发项目为由，在苗旭的王朝酒店举行了一个非常盛大的酒会，肖世杰带茹曼一起出席了酒会。同时被苗旭邀请的许智建也前往酒会。酒会上，茹曼见了苗旭……茹曼离开酒会后，柴笑天打电话约见茹曼，为了茹曼的安全，肖世杰陪同茹曼赴约。这时，窃取了指纹和密码的安柯潜入研究所，安装了监视系统。接到研究所出现异常情况报告的肖世杰快速赶到研

安柯逃脱了肖世杰和公安干警的搜捕。公安内部关于对有人潜入研究所一事的侦察意见发生分歧，许智建主张全市排查，肖世杰不同意，并再次提出对苗旭的怀疑，许智建指责肖世杰是个人英雄主义，两人发生分歧，会议不欢而散。面对自己的过往，面对国外人员的操控和命令，面对曾经的丈夫和一直深深想念的儿子，沈依萍已如一枚没有退路的棋子。为了挖出隐藏在暗处的罪犯，茹曼表面上被解除监护回到家中，为了她的安全，肖世杰在茹曼身上随身放置了一枚追踪器。茹曼对肖世杰和肖冰的感情，已越来越深厚，为沈依萍所嫉恨。为了讨儿子的欢心，沈依萍请肖冰和肖世杰吃饭，席间，茹曼的追踪器响了……

茹曼经过强烈的思想斗争，把苗旭对自己的恐吓告诉了肖世杰。却苦于没有证据，肖世杰无法采取任何措施。安柯在公交车上安置了自己设置的炸弹，肖世杰和未曾谋面的安柯进行了又一场较量。不肯服输的肖世杰单身一人排除炸弹，结果发生爆炸，虽然最终有惊无险，许智建还是严厉批评了肖世杰并命令他写出检查。为了SK，沈依萍和苗旭进行了明争暗斗，而面对情感的多重折磨，沈依萍希望能对用当初和肖世杰浪漫时光的回忆，重新赢得肖世杰的爱。

为了取得茹曼的信任，沈依萍特意给茹曼送了一条裙子，茹曼不想白白收沈依萍的礼物，沈依萍提出让茹曼请她喝咖啡。沈依萍开始了接近茹曼的第一步。距国际经济考察团来的日子越来越近，警方开始调整思路，决计不为眼前的这些假象所迷惑。许智建和邓建国两位局长经过协商后，决定撤消对茹曼的保护，并因为肖世杰私自取用设备科的定位追踪仪，肖世杰再次和许智建发生争执。同时，白小妍也开始直接接触茹曼，软硬兼施，她们的谈话被柴笑天窃听。苗旭为了弄清楚白小妍找茹曼的内情，让陶大壮将茹曼挟持到一家院子，通过定位系统找到茹曼下落的肖世杰与陶大壮发生枪战，同时，许智建及时派出了大批警察协助肖世杰，安全营救出茹曼。陶大壮被抓捕。国外黑势力决定除掉肖世杰，沈依萍申请由自己完成这个铲除肖世杰的计划。

陶大壮被抓三个小时后，在看守所自杀。肖世杰对其自杀的说法产生疑问，并开始怀疑公安局内部出现问题，在会上，邓建国制止了肖世杰说出自己的疑问。许智建却对肖世杰欲言又止的话产生了兴趣。茹曼的遇险，使她陷入惊恐和委屈，从而对肖世杰产生抱怨。柴笑天将偷听白小妍和茹曼的对话录音交给了苗旭，苗旭决定除掉白小妍。同时，许智建也得到了苗旭要除掉白小妍的消息，暗中派人保护白小妍。沈依萍在复杂的心态下，还是决定引出肖世杰，由安柯杀掉肖世杰。纪正龙跑去找肖世杰，告知他白小妍车祸身亡的消息，打破了沈依萍要安柯暗杀肖世杰的计划。

为了查清白小妍的真正死因，警方将酒吧的可疑人员抓回公安局询问，被询问人员一问三不知。同样因为白小妍的死，在邓建国和许智建的陪同下，肖世杰第一次正面接触了苗旭。虽针锋相对但一无所获。许智建开始思索肖世杰的一些观点。肖世杰开始暗中调查白小妍的死因，在酒吧打探消息的时候，遇到来暗杀他的安柯，两人发生了搏斗，均受伤，安柯逃脱。在医院，面对受伤的肖世杰，茹曼第一次袒露了自己的感情。肖世杰不置可否。安柯的受伤使得境外黑势力暂时撤销了对肖世杰的暗杀，责令安柯潜伏，并继续以爆炸来制造混乱。安柯重新找房子，认识了出租房屋的彭小玉。苗旭为了吸纳柴笑天成为他的亲信，让李栋指使柴笑天去杀死举报他们采用不正当手段竞标的杨总经理。

肖世杰来到看守所调查陶大壮自杀的情况，所长告诉肖世杰，在这期间，邓建国和许智建都曾在陶大壮关押时来过看守所。肖世杰走后，所长立刻给某人打电话，通报了肖世杰来看守所的情况。肖世杰私下里将内心的疑点指向了许智建。沈依萍根据国外的指示，利用茹曼达到他们的目的，开始对茹曼进行了攻心战，情感单纯的茹蔓对沈依萍的话毫不怀疑。安柯的手下在运送炸药时，被警方截获，当场自杀，根据截获的名单，警方推断出境外黑势力想要绑架国际经济考察团的考察人员。在许智建的部署下，公安部门对考察人员进行了保护。境外黑势力调整计划，命令沈依萍搅乱华安市，乘乱进入研究所，制造病毒，在九天后的国际经济考察团大会上散放到会场。安柯丧心病狂的在华安市天然气枢纽管道安装了炸弹，企图在考察团到来时，炸毁华安市。生性自负狂妄的安柯，安装完炸药后

搜查工作一直在无绪中进行，而茹曼却对沈依萍的感情日渐深厚。去医院换药的肖世杰无意中碰到送彭小玉去医院的安柯，两人的相遇让敏锐的肖世杰产生了无端怀疑。而两个护士无意的对话，却提醒了肖世杰，回到局里，他提出排查工作应该重点放在华安市的中枢——天然气管道的安装口。许智建默许了肖世杰的分析判断能力，警方从华安市天然气总工程师那里了解到，天然气管道的爆炸，不仅会将华安市夷为平地，还将危及到水库大坝，使下游地区的几个城市成为一片汪洋，形势非常严重。许智建决定撤消肖世杰对茹曼的保护，将他的工作重点放到这起可能的爆炸事件上。肖世杰不肯接受，摔上许智建的门转身离去。苗旭也正在静观柴笑天和茹曼的进展。肖世杰开始私下通过关系调查在舞厅坐台的彭小玉。

因为撤消肖世杰的保护，茹曼找到许智建提出抗议，并通过自己的特殊身份，迫使许智建暂时收回了决定。肖世杰的助手于华在劝解茹曼时，流露出了自己多年来对肖世杰的感情。沈依萍想和肖冰单独相处几天，却无法将肖冰从幼儿园接走，只得打电话叫来了肖世杰，肖冰依然不肯跟沈依萍离开，后来在同样来幼儿园接肖冰的茹曼的劝说下，肖冰勉强同意和沈依萍回去。肖世杰知道彭小玉对安柯已明显有好感，因此守口如瓶，肖世杰无奈，只得通过另外的渠道接近彭小玉。对天然气管道各个主要关口的排查工作，正在紧张进行中。苗旭依旧在为控制茹曼做着种种安排。

沈依萍利用保温瓶取得了茹曼的指纹，又利用一付特制的眼镜，获得了茹曼的视网膜，进一步实施了进入研究所的预谋……警方在排查炸弹的过程中，极为巧合地在隧道中，查到了一直隐藏在地下通道的苗旭手下毒贩郝老大一伙人，郝老大率领手下顽抗，双方展开了一场荷枪实弹的殊死搏斗……最后郝老大和手下束手就擒，一个胆小的手下供出了苗旭。警方经过周密部署，决定抓捕苗旭，苗旭却提前得到消息逃离，由此，肖世杰加重了对许智建的怀疑，找借口检查了许智建的手机，却没有查出蛛丝马迹。而许智建，也正对发生的一系列事情，产生同样的质疑。同时，肖世杰得到了茹曼的父母来到华安市的消息。苗旭为了保住自己，再次软硬兼施地和背后的神秘人物通了电话。沈依萍开始部署实施进入研究所的计划。

茹曼的父母对肖世杰极为不满，茹曼和父母发生了争执。肖世杰以查暂住证为名，来到彭小玉的住处，再次和安柯直接面对，因为彭小玉对安柯的袒护，肖世杰并未查出任何疑点，只得让线人继续监视。警方发现了苗旭的住处，肖世杰带队迅速赶到时，苗旭却已再次及时走脱，肖世杰开始对知情的两个局长同时产生怀疑。感觉到自己，正站在一个十字路口，进退维艰，而警察的使命又让他告诫自己不可放弃。此时的安柯，已利用沈依萍提供的茹曼的视网膜，顺利地进入到实验室，

肖世杰敏感察觉到研究所可能出现了问题，找到许智建请求调派警力，被许智建拒绝。肖世杰只得带着几个手下赶到研究所，并通过监控设备发觉了有人进入实验室，再次和安柯进行了交锋，打斗中安柯凭借曾经安装的热感监察器逃脱，但胸口中了一枪，留下了血痕。随后赶到的许智建向肖世杰道歉，肖世杰不置可否。沈依萍命令安柯停止和肖世杰的争斗，暂时不得擅自行动。肖世杰找借口调查到彭小玉的住处，再次被安柯蒙混过去。苗旭在和自己背后的神秘人物见面，以重金诱惑其帮自己度过难关。

沈依萍将一个装有摄像镜头的项链送给了茹曼，茹曼推辞不过只得接受。通过项链的摄像头，沈依萍将茹曼的举动全盘掌握。为进一步查清案情，邓建国、许智建和肖世杰再次对郝老大进行审问，不料，郝老大当场翻供，指证肖世杰刑讯逼供。肖世杰的工作受到牵连，并一怒之下，和自己多年的合作伙伴纪正龙反目。邓建国勒令肖世杰停止对苗旭的调查。许智建却在上级面前为肖世杰说情。始终关注肖世杰的于华，答应肖世杰协助他私下监视苗旭的行踪。警方对苗旭的通缉因证据的丧失，只好取消。肖世杰怒斥苗旭，总有一天会将他绳之以法。而茹曼再次看到当年写给柴笑天的情书后，内心产生了悸动。柴笑天告诉茹曼，自己是公安部打入苗旭的“王朝”内部卧底的消息，更是让茹曼大吃一惊。沈依萍的即将离开，让肖世杰不免伤感，动情之际，肖世杰得到了地下通道发现不明物体的

一场开诚布公的谈话，让肖世杰和纪正龙这对曾经一次次共同出生入死的战友，再度联手。肖世杰伪造了一份邓建国的手谕，来到看守所提审郝老大，恰遇郝老大和他的手下中毒身亡，郝老大临死对肖世杰说了至关重要的一句话。肖世杰在邓建国办公桌抽屉里，无意发现了一个电话卡……肖世杰指派于华查清了那枚电话卡的秘密，证实了自己多年来视做手足的邓建国，就是公安内部苗旭的保护伞。许智建也接到省公安厅的指示，信赖柴笑天并配合他的行动……面对生活中人与事的一系列翻天覆地的变化，茹曼不由发出深深感触。拿到资料和部分元素的柴笑天向苗旭提出要和直接要货人见面。肖世杰通过线人得到的安柯的指甲，经过DNA检测后，确定了安柯就是屡次进入研究所的罪犯。警察赶到彭小玉的住处后，安柯已离开。

安柯从电脑监控器上，发现有人接近他安放在水库大坝下面的炸弹，化妆成公安干警，进入隧道，却与正在准备排除炸弹的肖世杰相遇，两人经过殊死的搏斗，肖世杰负伤，安柯毙命。肖世杰终于将钛金属真空炸弹排除……沈依萍看过柴笑天获取的资料后，同意和柴笑天见面。苗旭安排李栋在交易完成以后杀掉柴笑天。沈依萍对刚刚对她产生了感情的肖冰依依不舍。内心的罪恶和母亲的天性，让沈依萍痛苦不堪却无退路。肖世杰质问了自己信任多年的战友邓建国，告诉他自己终将把苗旭绳之以法。邓建国竭力否认，内心慌乱不堪。沈依萍开始实施最后的犯罪计划，她设计引开茹曼身边的警察，绑架了茹曼。

邓建国的事情败露以后，开枪打死了苗旭，跟踪而来的肖世杰目睹了一切，邓建国企图杀死肖世杰，制造肖世杰和苗旭在对射中同时死亡的假象，此时许智建派来保护肖世杰的欧阳带着刑警赶到现场，击毙了邓建国。沈依萍绑架并在茹曼的腿上绑了一枚炸弹，拿着茹曼的证件赶去了研究所，无法挣脱绳索的茹曼最后按响了定位仪。此时的沈依萍已经完成了病毒的合成。肖世杰和柴笑天找到茹曼，茹曼告诉两人，沈依萍要将病毒放入会场的中央空调……肖世杰急忙赶去会场，柴笑天留下帮茹曼拆除炸弹。在炸弹即将爆炸的最后一秒，柴笑天在肖世杰的电话指导下，终于将炸弹拆除。潜入会场空调房的沈依萍正要释放病毒，肖世杰及时赶到，在千钧一发之即，将执迷不悟的沈依萍亲手打死，避免了这场惨重悲剧的发生。一切结束后,肖世杰抱着孩子回了省城。