剧情图片Watson上校来到办公室，电脑传出一个奇怪的声音，告诉他的妻女已经被绑架，必须挪用两百万才能救她们，他被摄头监视不能移动，于是偷偷求救NCIS。Kate和McGee来到上校的家里，发现这对母女是被骗走的。Gibbs授意Watson上校让绑匪释放他的女儿。女儿是个盲人，有着超乎寻常的听力，她听出了绑架地点，但是绑匪显然不是主谋……

施工队挖出了一个隐藏的地下室，里面有一具干尸，身上穿着新娘的服饰……女尸是海军中尉，经过验尸发现已经死亡两年。屋里的摆设和书籍都是五十年代的风格，Gibbs率领手下调查发现，很有可能是个迷恋五十年代女性的变态杀手。很快又有新的女性失踪者，Gibbs利用Abby从昆虫身上得到的线索，来到一处海军基地……

剧情图片黑鹰直升机停在小村庄的神秘稻田圈上，两名陆战队员失踪了，当地村民声称是飞碟来访……McGee在树林中发现一间被烧毁的小屋，里面有一具被烧焦的人类尸体。Gibbs发现村民的行为越来越可疑，究竟有什么不为人知的秘密？怀孕的少女被什么胁迫了？

两名海员在路边发现一具穿着上尉军服的女尸，Ducky医生在检查尸体的时发现了一个三叉戟的烙印，勾起了他的回忆，十年前一名女尸身上留有三叉戟的烙印。当时入狱的那个变态杀手刚巧在几周前出狱就医，Tony和McGee来到他的住处堵截，却发现他已经死了两周……

剧情图片有个被捆绑的人醒来发现自己在了海军的实弹演习场，尽管他努力逃跑，还是被炸身亡。Gibbs率队来到现场调查发现不止一具尸体……Fornell突然来访，原来死者是FBI打入黑帮的卧底，显然有内鬼出卖了他。Fornell也遭陷害入狱，在狱中他请Gibbs要找出内鬼，谁知不久Fornell上吊身亡……

海军女飞行员Maggie在超市停车场遭到炸弹袭击，幸免遇难。Maggie在阿富汗时中曾经误炸平民，Gibbs怀疑这是伊斯兰极端组织的报复行为。FBI再次插手，Gibbs找出了疑犯，但是FBI隐瞒消息并且干预Gibbs审问犯人。第二次爆炸又发生了，Gibbs利用FBI的软肋威胁了他们，双方达成交易，罪犯顺利收押。他们在开往总部的路上接到Abby的电话，凶手还有另一批……

一位老人找到NCIS总部，声称自己杀了人，Gibbs发现他是二战英雄，是硫磺岛战役幸存者。老人刚失去了相伴的老伴，由于悲痛很多记忆消失了，但是坚持自己在二战时杀了好友。Gibbs申请开棺验尸，尸体头上被击打的凹槽和证物手枪的枪柄吻合。海军军法署决定羁押老人，但是Gibbs找了一个当年同在硫磺岛的日本老兵，他要尝试重新唤起老人的回忆……

深夜做完心脏手术的Dornan上校突然在病床上自燃爆炸了。McGee检查了医院录像，在Dornan死亡前出现了一名海军少尉。Gibbs、Kate找到少尉时，发现他正在尝试自杀，Kate意外击毙了他。他的游泳教练是他生前最后一个谈话者，他证明少尉是无辜的，Kate陷入了深深的自责。Abby模拟了引爆过程，证实是输氧管爆炸导致，可是怎么点火仍旧是个谜团……

海军基地，有人闯进Lowness太太的家企图强奸，Lowness开枪击中了他。Lowness太太说没见过来人。医院里的强奸犯说自己是被邀请去Lowness家的，他们在一个情色网站相识。Gibbs和Kate在Lowness家中找到了他们来往的电子邮件。Abby混进网站发现服务器被盗用，Lowness是无辜的。但当他们赶到黑客家里时，那里只有一具被挖去双眼的尸体……

剧情图片Tony卧底监狱和贪污犯White转狱，他们制造了一起逃脱事故。White始终没有招供他在伊拉克偷运的古董下落，而本人又毛手毛脚，几次意外却让Tony和总部失去了联系……副国务卿一直跟踪此案，不胜其烦的菜鸟McGee终于让对方闭了嘴。Kate发现新的线索，White不仅是盗窃犯，手上还有三条人命，手段及其残忍，众人为Tony深深担忧。循着Tony留下的记号，Gibbs和Kate追踪到了他们，但是车里的Tony已经向White表明了身份，不动声色的White偷偷取出了刀……

失踪了两年的海军上尉Brian的意外被发现，他和汽车一起沉在黑湖里，他的家人悬赏100万寻找他的下落。尸检中发现了子弹，Brian的弟弟Tom成了最大的疑犯。发现尸体的是著名私家侦探Cooper，他不厌其烦的找到Gibbs希望可以结案，以便他领取赏金。Abby修好了Brian的手机，发现他死前的最后两个电话是Tom打来的……

电话公司销售员正在向一名海军下士Lamport推销电话服务，却意外接听了一起谋杀案。Gibbs来到现场，屋里到处是打斗的痕迹，Gibbs根据血滴形状断定下士诈死。下士牵扯大额的非法药品倒卖活动，他的失踪似乎恰好解释了他的罪行。但不久他的尸体在公园里被发现，货也被拿走了，Gibbs仅有的线索只是尸体旁边的烟头……

Ducky医生在家收到的人肉碎块拼成了三具尸体，身份是当年Ducky医生作证的一起强奸杀人案的法官、检察官、律师，案犯是医学院学生VinsonHanlan，而Hanlan已经在一年前的车祸中丧生。Ducky医生处境危险，Kate和Tony负责保护他和老母亲，可是深夜，Ducky医生在家中被劫走了……

女孩报案住在对面楼里的海军被人勒死，可警察在现场找不到任何痕迹。Tony和Kate在模拟现场时发现了可疑的人类尿液，经过搜查找到了藏匿的现金。女孩想不起凶手的长相，Gibbs派McGee在案发现场监视，结果女孩在和McGee通电话时被杀害了，McGee在慌乱中也没有看清凶手的特征。死亡海军的尸体在公厕被发现，McGee在催眠师的帮助下想起了……

剧情图片在雪兰多国家公园，海军中士从山崖坠下身亡。目击证人只有中士的妻子和好友，他们告诉中士在失踪之前和公园里的流浪汉有过冲突。Abby在死者头上找到了棒球棍的碎片，中士是被谋杀的。中士手持的摄像机在河边被找到，虽然损坏严重，但里面的画面证实了中士妻子和好友有私情，他们作为嫌疑犯被羁押。Abby再次检查录像，在中士滚落山谷的一瞬间，录像机还是开着的，它真实的记录了那一幕……PS：第一次野外出勤的McGee被Tonny坑了……

海军中尉Amanda被害，疑犯坚决声称自己是无辜的，认为死者不是和自己一夜情的女孩，那个女孩是酒吧的舞女。Abby证实虽然疑犯满手是血，可是凶器上却没有指纹。Tony和Kate来到酒吧，意外的见到死者的妹妹Samantha在台上表演，Amanda生前因为妹妹的事情找过酒吧老板。酒吧老板把Samantha叫进办公室。等到Gibbs冲进去，事情远远比看到的复杂……

一对人类眼球寄到了海军中士Benjamin家里，但是Benjamin否认和这些有关，不久Benjamin在家里自杀。Benjamin的老师Purcell是海军秘密行动的讲师，还是在巴拉圭活动的间谍。眼球的主人确认是一个17岁的女孩，她还有一个身份是Purcell的妻子。Tony和Kate受命去巴拉圭秘密调查证据，因为有大人物保护Purcell……

弗吉尼亚海滩正在进行泳装秀，三号选手却死在厕所。死者是海军中士DifuniJordan，临死前曾给瑜加课教练Lisa打过电话，但是Lisa称Difuni是自己的学生之一。一个出狱的男子给Difuni写过很多信，可他却有不在场证明。Ducky医生检查出死者生前已经怀孕，而Tony也查出死者有个神秘的男友，是个业余摄影师，他替Difuni拍了登在杂志上的照片，而这个摄影师还有另一个身份……

海军中尉Jessica夜晚被魔鬼一样的声音威胁，Gibbs带人前去调查，Jessica的主治医生认为是幻觉。入院前Jessica在海军秘密机构工作，她的上司Wade上校被控在政府交易收取回扣，上校却坚持自己是清白的。电话中Jessica说有东西在她房间，等到Gibbs赶到，Jessica在病房上吊自杀了，但是Abby发现这是布局精巧的谋杀……

深夜正在举行兄弟会活动的海军学员发现了一具脖子被折断的尸体。死者是海军学院的Turner，死亡方式是陆战队的专业手法，队友Blake成了疑犯。Abby的电脑被黑客侵入了，McGee循着信号追踪，竟然找到了Blake的尸体，死亡方式和Turner一样。电脑黑客被抓，他告诉Gibbs两个死者有一个共同的女友Ashley，可Ashley告诉他们两人在几天前在帮她躲避教官的骚扰……

陆战队士兵Tuobusi牺牲在伊拉克，他的朋友Amy整理他的储物仓时发现了尸体，是他青梅竹马的朋友Nora，在两年前失踪。海军调查委员会命令Gibbs查出真相。当地警长和Nora父母都认为是Tuobusi是凶手，因为在Nora失踪后Tuobusi突然参军去了。Kate和Gibbs询问Amy，Amy欲言又止，之后竟然割腕自杀了，案情扑朔迷离……

剧情图片NCIS收到一封印着唇印的信，Tony抢着打开后吸入里面的白色粉末，Tony和Kate一起进入隔离病房。粉末是生化鼠疫病毒，Abby和Ducky读了那封信，要求NCIS公开几年前的一起海军强奸案，疑犯依然逍遥法外。强奸受害者名叫Sasha，她的母亲Hannah是生化研究机构的执行总裁。Hannah被捕时说自己只是想要公道，Sasha坦白当年的强奸案自己说谎了。Tony被感染了，只有百分之十五的生存率，可怜的Tony危在旦夕……

剧情图片两名海军飞行员在度假途中被杀，其中一个被剁去了双手，Gibbs带队调查时又险些被汽车里的炸弹炸死。炸药的成分和匿名的911电话表明是职业特工所为。Fornell告诉Gibbs，Ari已经脱离FBI的掌控，他的目标是杀死Gibbs！Gibbs查明海军一架无人飞机被盗，此时海军舰队就要回港靠岸，Ari已经是彻头彻尾的恐怖分子！船就要靠岸了，飞弹已经飞出，Gibbs他们只能全力阻止悲剧发生……