玉云龙是平安客栈的少当家，替东厂唱好武林，其姊娇凤却不满他替东厂办事。云龙带男旅客到澡堂洗澡时，东厂千户仇在心突击检查男士臀部有否「仙姑坐莲」刺青。力士向武林盟主任我飞挑战，欲揭穿五大派的武功造假；二人比武时在心使出暗器打败力士。东厂统领仇不群向五大派派发补药「恩赐丹」，实则化去他们的功力；不群提醒各派参加新一届新晋英雄大赛。不群因谊女在心整天记挂为父母报仇而心烦，後悔当年骗说她的父母被人杀死。

云龙迷恋城中以卖豆腐花驰名的艾冰冰，表明会向她提亲。不群安排在心和朝鲜使节闵大人相亲，在心却与云龙先口角後动武。鲁公公找到神医替不群炼丹，药名仙姑坐莲；在心会错意，竟烧毁丹药。娇凤不满冰冰迷惑云龙，又见她勾搭上届新晋英雄魏英雄，找她算账。不群有意撮合在心和副千户田青华。冰冰推着豆腐花到招募大会销售，英雄替她推销却未料木桶打开後飞出大群屎蜢。云龙带冰冰逃走却未果；云龙为救被囚的冰冰向村民追查线索。

冰冰被英雄接走後，退还云龙的订情信物。云龙决心参加新晋英雄大赛，盼获奖後令冰冰回心转意。谢过和段背山参加游览团巧遇大漠女子完颜无辜，无辜误会背山对她有意。云龙揭破孔杂开黑店卖假货。坊间传言在心恨嫁，在心心知是云龙散播谣言，决要向他报复。无辜参选新晋英雄，被毒蛇所咬而昏迷，幸得谢过仗义替她吮去毒血；无辜醒来见背山替她包扎伤口，认定背山是真心英雄。云龙、谢过及背山被编入纯真派，无辜被编入玉女派。

云龙被打致重伤昏迷，模糊间听到不群教训在心，他甦醒後便故意扮傻。不群得知娇凤送美食给云龙，令不群回想当年娇凤曾为他炮制菜肴的往事。谢过偷偷上思过崖探望云龙，表示愿意帮他对付在心。小龙姑认定与背山的姻缘是天注定，背山坦言谢过才是他的心上人。云龙未知在心已识破他假扮疯癫，害人终害己。在心故意挑选谢过为本届新晋英雄，并指定由云龙扮演神雕。小龙珠派小龙姑用毒针对付谢过，让玉女派弟子有机会补上位置。

云龙以不明神雕的背景为由，有意刁难在心。在心在彩排时故意安排神雕在圣火中诞生，云龙险被焗至窒息。新晋英雄颁奖礼上，云龙当众脱去神雕外衣向皇上揭破东厂造假黑幕。东厂十兽向空中抛掷忘忧散，孔杂乘乱引爆金鼎。娇凤晕倒，皇帝除下面谱救娇凤，原来他竟是不群。小龙姑、谢过、云龙被囚在监牢；在心故意找冰冰前来以说话伤害云龙。东厂十兽批阅众囚犯的悔过书，当中云龙写出了他与冰冰缠绵的幻想情节，众人看得热血沸腾。

云龙推测不群痴恋娇凤，故意胡乱撰写他们郎情妾意的爱情故事。全京城男人迷恋娇凤风情，而女人则恨她入骨。孔杂偷听到东厂找人假扮我飞，欲揭穿东厂欺瞒天下，同时找到年约九岁的小孩童宝宝帮手对付不群。云龙要向在心报仇，在悔过书写下自小已和在心相识的故事，在心看罢气得七窍生烟。陈香莲不满青华是副千户职衔，教他赶走在心取而代之。娇凤跟踪我飞到庙宇，将他打晕抬至山坡上，另一个黑衣人欲抢夺我飞。

不群命在心混入平安客栈执行秘密任务。原来二十年前，皇帝要铲除我飞和武林人士，不群只想议和被逐出师门；皇帝提出只要能阻止我飞等人的对抗，愿意与武林议和；不群引我飞入皇陵困在当中。不群怀疑我飞练成「普善真经」的武功，更担心真经会落入乱党手里。娇凤催促素素杜撰真经，让不群抢夺。在心躲避流莲追杀，云龙替她打发留莲离开，并请求娇凤收留她。谢过为摆脱小龙姑痴恋，约她翌日到树林相见，同时又约会小龙舟。

鲁公公翻译在心偷来的字条，不群怀疑皆是娇凤杜撰，打算将计就计。云龙和在心准备祭品，这时孔杂带着宝宝、乔装的真汉子和小龙珠、村妇艾雪均来投栈。此时，蘇虾假扮修士入来硬塞「普善真经」给云龙。不群要在心继续监视孔杂和宝宝，以及堆田派的艾雪。云龙向在心讲出自己的身世，且发觉娇凤与不群有不可告人的秘密。孔杂带娇凤到青山派密室，向娇凤索取真经光复武林。冰冰求云龙回到身边，艾雪出现称冰冰是她的女儿。

在心从冰冰母女手上救走云龙，来到皇陵附近时突然地陷。二人寻找出路时，遇上武林盟主任我飞，他们决定带他离开皇陵。回到城後我飞使出武功锄强扶弱，云龙指他犯了禁武令，在心向他解释禁武经过。孔杂、艾雪和宝宝要胁娇凤交出真经，这时云龙带着我飞回来，我飞劝他们暂时不要找寻真经。娇凤向在心表示会带我飞离开中原，更希望不群可以放过我飞。在心劝不群放过我飞，不群答允；不过他已决定重选新盟主，且由百姓投票。

云龙见我飞可怜，求娇凤收留他。鲁公公劝不群放下恩怨，不群不信我飞已失去武功，认为他正在背後策划阴谋。云龙在客栈摆下龙门阵，邀我飞尽诉武林秘密。我飞自责未能管束五大派，劝百姓在新武林盟主选举中投白票。孔杂、艾雪和宝宝与我飞商议光复武林之事，我飞表示以医治好双眼为首要目的，希望有人肯跟他以眼换眼。小龙珠因选情告急，由弟子带她到思过崖找小龙姑下山为她拉票。朝廷贾大人宣布青华当选盟主，五派人人意外。

艾雪、天蚕脚、封尘三侠和双生儿等人中毒，神智不清。鲁公公查出毒药名为「万紫千蛇」，暂时只能服用「黑明丹」控制。云龙困绑所有中毒的英雄，由他看管。我飞走到郊外燃点迷烟，引来无数万紫千蛇。当年他困在皇陵，在石棺里找到普善真经，按照真经练功，练完一式便吞下经书，直至练到第十式。孔杂假装中毒混入武林圣地救人，隐世英雄均不愿离开。我飞向他们发放暗箭，箭上绑着的小纱包，突然冒出浓烟，英雄吓得四散夺门逃跑。

我飞提议孔杂自断手筋，诬衊是东厂所为。皇上因不群替百姓解毒有功，册封为大将军，赠四爪蠎袍，以及能医百病的「金龙之子」。孔杂闯进，指自己双手被东厂人废掉，以及不群种种恶行，呼吁群众推翻东厂。我飞乘云龙不为意打他落山崖。云龙被救起时筋骨断裂，经脉尽毁；素素、在心等将内功输给云龙，令他起死回生；其後我飞再灌入真经内功，令云龙三日内已达十年功力。不群在在心房间，发现一男一女无头布娃，知道在心已爱上云龙。

在心潜入不群书房，发现一块仙姑坐莲刺青人皮，便追问不群；不群指我飞当年屠杀燕南村，包括她的父母在内，而我飞害怕被人知道他肩上的刺青，便找师父割了这块刺青人皮。不群教在心利用金龙之子向我飞复仇，我飞生疑没有服用金龙之子。不群揭穿是我飞教云龙和在心学真经武功来对付他，他为保云龙两姊弟和在心，在树林设下陷阱刺杀我飞。云龙劝在心离开东厂，与他实现梦想，在心感动。艾雪连日来未见过冰冰，大家才醒觉冰冰失踪。

在心和云龙夹计令冰冰学懂掌控寒冰气。在心送饭给谢过、龙姑，途中遇见乔装的九索飞环，被骗吃毒蘋果，马上晕倒；我飞在双生儿合力下向在心输入邪术，令她产生幻觉，见到不群杀死她的父母。鲁公公告知不群金龙之子不翼而飞，不群认为是在心偷去，此时在心闯进追杀不群。云龙和冰冰赶到，冰冰用云龙教真经第十式心心相印发掌攻击不群；在心乘机对付不群，反被他打晕。鲁公公替在心解除毒液，在心甦醒後痛心不知谁是杀父母仇人。

我飞得悉客栈有条秘密通道可通往皇宫，意欲刺杀皇帝。娇凤又在密室用大钉刺激孔杂穴位，孔杂突然讲出硬闯昆仁秘道入皇宫杀皇帝。娇凤推敲昆仁秘道就在客栈内，所以我飞迟迟不肯离开。在心告知不群，我飞已知道他的秘密，且威逼娇凤嫁他，否则将他的秘密公告天下，在心劝不群离开。娇凤换上新娘裙褂，要我飞遵守承诺。各大派到客栈祝贺我飞，这时不群从天而降，他的肩膊孭着布袋内露出新娘裙，提出要我飞到皇陵与他决一死战。

云龙怪在心不信任他和冰冰，令娇凤被掳走。不群来到城楼下，我飞催逼他上城楼自揭秘密。我飞限娇凤三日内找出秘道，否则血洗客栈。娇凤找到的秘道入口被封闭，命素素和蘇虾静静通知皇帝我飞意图弑君。云龙找在心到破庙练真经第十式，岂料是冰冰应约。在心代替不群主持东厂，强逼五大派服食恩赐丹，又找到他们的镇派之宝，可是全部宝物都有破损。云龙带我飞到大殿宣布成立「真盟主同盟」，由我飞担任武林盟主，向五大派清算旧账。

娇凤主动要求与不群成亲，但他依然不肯露面。在心为取代不群的职位向他认错，不群没动怒，反而赞她懂事。我飞逼云龙饮毒酒，令他服从。五大派掌门向众人宣布他们入了郎爷榜，因为他们打败青华在郎爷榜上被表扬。可是天蚕脚和封尘三侠因满身垃圾上了五花大榜，令我飞气极。汉子与四派联谊，在心出现，指东厂经费紧绌，以後不向他们派发恩赐丹和俸禄。隐世英雄向我飞索取生活费，我飞以为东厂已被他打沉，拒绝再养活他们。

云龙安排隐世英雄和五大派卖艺，赚个盆满钵满，各人开心给他回佣。云龙向我飞献上金银珠宝，以索取解药，我飞欲教训他却力不从心。云龙告诉在心我飞无法运功，求她一同练习真经第十式，杀他一个措手不及。在心依然恨云龙与冰冰关系暧昧，云龙不敢明言身中雕毒。孔杂身穿龙袍被云龙发现，追问他如何得到龙袍。艾雪告知云龙冰冰要离开京城。云龙和在心向冰冰送行；云龙毒发，冰冰提议用寒冰掌救云龙，但他宁愿变成大雕守护在心。

娇凤愿跟随不群对付我飞，但不群点了其穴道独自离去。不群备了酒跟我飞同饮，表示师徒恩情已断，二人对战……不群甦醒後失去记忆和武功，我飞命百姓凌辱他。不群认为娇凤是其妻子，云龙是其儿子，却不认识在心赶她离开。在心要为不群报仇，约云龙用昆仁雌雄双剑练习心心相印，可是剑气不足，无法达到心灵合一；在心以为云龙心中仍有冰冰。云龙剧毒发作，到武林圣地恳求我飞放过他一家。我飞限他三个时辰找到秘道，否则血洗客栈。

（大结局）成为东厂总督的我飞向五大派和隐世英雄表明，继续执行英雄名册和派发恩赐丹，又将五大派掌门收监发落。云龙和在心已知我飞有善恶两面，只要消灭恶飞便可收拾我飞。我飞使出心心相印吸去云龙和在心的功力，他发掌杀二人时，突然善飞和恶飞自其体内窜出，两人对打。不群恢复神智，鲁公公向他透露云龙身中雕毒。不群向云龙指出皇帝非好人，只要他依然在位，英雄名册和恩赐丹依然存在，箝制武林人士，但云龙不信皇帝奸恶。