三年前，横滨。港东署强行犯系系长樋口彰吾以破案率高而自傲。这天，他正在追踪犯罪集团时，注意到妻子未希的来电，但他以工作为先，没有理会，却不知那是妻子发来的求救电话。这时，在再开发地区，被神秘杀人犯追赶的未希屏住呼息，打110求助。在港东署紧急指领室，接到未希求助电话的警部补橘光虽从未希的声音中感到了事件的紧急性，她回拔被挂断的电话，得知了杀人魔所在的地方，也听到了未希被残忍杀害的声音。樋口收到后辈石川透的电话后，不顾同期、犯罪二系冲原隆志的制止，冲到案发现场，目睹了妻子的惨状，痛苦得无法言语。一个月后，涉嫌杀害未希的相良站在了法庭上。他称案发当天自己喝得大醉，所以不记得发生了什么。橘光作为检察方的证人，作证说相良的声音不是她当天在电话中听到了犯人的声音。她说如果调来通话记录就能真相大白，但是

凭借从电话听到的细微的声音，橘光找到了被害人被监禁的地方。女大学生连续杀人案解决后，光以三个月为条件得到了设置ECU的许可。她邀请樋口担任调查现场队长，但是，樋口不相信光能根据普通人听不到的声音找到监禁之地，拒绝了她。另一方面，根据田所署长的指示，强行犯系的冲原开始刺探光刚回到紧急指令室就要把樋口招下麾下的真正目的。第二天一早，樋口在长期住院的儿子大树的病房中醒来，他接到后辈石川的电话，得知自己被调到ECU。满腹牢骚的他为了试探自称能听到普通人听不到的声音的光，故意在离得很远的地方跟她招呼。果然，光听到了普通人听不到的樋口的声音。面对樋口的质问，光说明了有关自己听力的秘密。樋口这才知道三年前未希被杀一案的背后还有一桩把光也卷进来的悲惨事件。事件的经过让他震惊。

在县警工作的栞报警说妹妹葵被绑架了。光直接命令樋口去现场，根据葵的手机GPS情报展开搜索。葵被犯人搬进车里，所以很难掌握详细位置。就在这时，他们接通了葵的手机，葵被人塞了毛巾，只能发现含糊的声音。光集中精力分辨从手机中传来的现场周围的声音，推测出了葵所坐车辆的种类和位置。正在现场搜索的樋口相信光的能力，开始追踪相应车辆。根据车辆信息，车主是葵曾经交往过的大森。樋口尝试劝说犯人停车。另一方面，强行犯系的冲原不看好ECU，为了打败ECU，他发动部下抢先逮捕犯人。在错综复杂的搜查网中，樋口注意到某件事，于是返回警署。栞和姨母志津，以及葵的恋人新田也赶到警署。栞非常不安，因为自己没好好和妹妹谈谈而懊悔。樋口在栞一起等待时，从她那里听说了一条线索。他和光发现整个事件是事先安排好的陷阱。

离葵被绑架已经过了四小时，警方还没有掌握她的下落，而离为逃亡海外筹集资金的新田预告说要直播强奸葵的时刻越来越近。冲原等强行犯系警员在被认为是新田逃跑通道的港口那边严阵以待，但樋口等ECU成员与冲田他们发生了冲突。ECU采取了与强行犯系不同的行动，全力搜寻葵的下落。就在葵面临性命之忧时，光告诉樋口，新田暗示自己与樋口妻子被害案有关。另一方面，在紧急指令室里，正调查新田过去经历的绪方意外地发现了他的真实身份。听说此事后，栞认为妹妹应该是被监禁在废弃的中学里。樋口和光、石川急忙前往那所学校。

新田死于非命，橘认为是三年前那个案子的真凶杀死了新田，更怀疑冲原是凶手在警方内部的帮手。在现场搜集证据时，樋口和橘发现了真凶的某个特征。就在这时，新加入ECU的栞接到六岁小孩阿步的报警。他说被妈妈刺伤，现在正躲在洗衣机里。橘察觉到案件的异常性，指示樋口和石川出动。但是，阿步不知道妈妈的名字，而因为妈妈不许他出房间，所以也不知道住处在哪里。电话那头传来的声音表明阿步的母亲气急败坏地在到处找他，而ECU现在能查到的只是阿步的房间位于一个庞大的住宅区内，几乎不可能查到他的具体位置。橘一边鼓励阿步，一边试图通过碎片似的情报拼凑出案件的全貌。离接到报警已经过了十分钟了。紧急指室里响起阿步的悲鸣。被害人危在旦夕，这正是考验ECU团队能力的时刻，而一个黑影正悄悄接近快要追查到三年前案件核心的樋口。

樋口致电橘说自己已掌握真凶的情报时遭人袭击，从此没了消息。惊愕的橘虽然怀疑冲原是内鬼，却也只能借助他的力量寻找樋口。石川根据樋口手机的GPS情报赶到现场。便是，拿着樋口手机的却是一个意想不到的人。这时，被监禁在废弃工厂的樋口终于见到了橘所说的下马会咔咔作响的男人。那男人承认是自己杀害了樋口的妻子，他还领令部下杀死樋口。樋口被男人的部下团团围住，虽然形势不利但仍坚持战斗，但男人的手下用改造的手枪击中了樋口。就要枪声响起时，冲原等强行犯系刑警赶到。田所再次警告橘不要擅自重新调查三年前的案子。而橘请求通辑杀害新田和袭击樋口的嫌疑人。冲原把调查的动向向某人汇报。另一方面，在大企业本乡集团的总部，会长本乡辰夫正召开建设再开发工区的新闻发布会。就在本乡心情大好之时，秘书报告说某人被通辑了。

橘光发现冲原在追踪“下巴会咔咔响”的男人时遇害。在医院，樋口在抓住袭击大树的男人长坂后听说了冲原的死讯。通过这一连串事件的残忍手法，橘和樋口开始意识到真凶另有其手。这时，成为本乡集团社长的真凶本乡雫嫁祸给他用暴力和恐怖手段控制的义兄，自己却过着无忧无虑的日子。樋口和橘从未希遇害时犯人所说的“因为你太得瑟”这句话入手，考虑案件也许不是随机杀人。他们发现当时作为社会福利工作者在自立支援机构工作的未希与真凶有意外的交集。就在这时，ECU接到报案说“叫高木的男人劫持人质要从阳台上跳下去”。高木是个派遣土木工，他说自己要被周围的公司男职员们杀死，再三地求助。樋口与石川到达现场。公司的人接近高木想说服他，但是那样子让在现场的樋口和在紧急指令室的橘感到不对劲儿。

樋口在旅馆发现了上杉的遗体。他因为失去找到真凶的线索而怒火中烧，看到他的样子，光与石川都很痛心。这时，雫正在欣赏家中陈列的杀人时使用的凶器，他忽然注意到自己不在家时屋子的壁橱有被打开过的痕迹。樋口很后悔在未希生前没有认真听她的心事，发誓要抓住真凶。他从上杉的手下那里听说，本乡集团经由上杉公司之手违法强逼流浪汉做违法的工作。就在此时，检察厅特搜部对正在追查失踪的流浪汉的樋口进行强制搜查。因为樋口被处分，ECU也面临解散危机。但是，光觉得这种以不正常的理由施压的做法极其可疑，更怀疑ECU内部就有真凶的间谍。而那个人的真实身份出人意料。樋口与光对于本乡之子雫在冲原被杀之时出入案发地却没有作为重要证人被传询感到不解。这天晚上，光回到自己家，在门外她听到了一个拿着铁球状物体的人正接近自己的脚步声，非常

本乡集团承包的地铁扩张工程施工现场发生了崩塌事故。赶到现场的樋口指示紧急指令室发出救助要求。而橘从手机中传来的声音里发现隧道有煤气泄漏的声音。樋口与石川冒着爆炸的风险冲进隧道，凭借橘听到的声音在黑暗中寻找着幸存者，就在这时煤气泄漏引起了爆炸。就在消防队灭火时，樋口从开发反对派中的一人口中得知，本乡集团所承建的其他施工现场也发生过事故，产生了怀疑。就在这时，雫出现了。雫的挑衅让樋口十分气愤，而在他身旁边、与雫有秘密联系的石川却身体僵硬。ECU着手调查本乡集团所经手的工程，查明管理体制形同虚设。而樋口与橘寻找雫杀人的证据时，从未希留下的录音听到了细微的海浪的声音，推测雫反复杀人的场所是在海边。橘主张把有内奸嫌疑的石川排除在调查团队之外，樋口却称自己要找出石川与犯人勾结的理由。他从本乡集团转包商的

樋口飞快地赶往雫的别墅。他发现了雫的车和血迹，断定失去消息的石川就在别墅中。他进入别墅，但室内空无一人，在指挥室监听现场声音的橘注意到别墅有地下室。樋口得知后马上前往。在那里他发现了满身是血昏迷不醒的石川。这时，雫袭击了愤怒的樋口。二人进行激烈的枪战。最后，闻讯赶来的强行犯系刑警逮捕了雫，而雫却继续挑衅怒不可遏的樋口。橘到现场与樋口汇合，她告诉樋口“制造怪物的是”。紧接着她想像了因为纽曲的父子关系而变成杀人魔的雫的内心。就在这时，救护车的无线电传来消息，雫身体情况恶化昏迷不醒。二人觉得事有蹊跷，连忙赶到医院，却听说被警方控制的雫服毒自尽了。橘和樋口十分怀疑，结果发现载着雫的车从医院的地下停车场驶离。