内森詹姆斯号越南遇袭。全世界都在从经历了恐怖的病毒袭击中慢慢恢复，在美国的密苏里州圣路易斯市，新任的美国总统杰夫瑞米切纳在通过电台向全美国人民发表讲话。而此时拯救了世界的美国海军舰内森詹姆斯号舰长钱德勒正开着车在街头，他看到了街上的人民正在慢慢的恢复正常的生活，在银行没有办法正式运作前，政府封发了配给票用来替代交易的货币。街头的建筑上也有钱德勒喷漆头像。日本南部，因为病毒的突然变异导致美国生产的治愈药没有效果，到处都是因为病毒而死亡的人，一位老妇在一个小女孩旁边正准备给她再打一针治愈药，可是小女孩病没有撑过去，老妇看着死去的亲人悲痛欲绝。在美国，海军军士官格林的妻子卡拉正在跟自己的丈夫在进行视频通话，但是因为一些不明的阻扰通讯没办法进行。南海，内森詹姆斯号上正在继续着分发治愈药的行动，因为现

迈克等船员被海盗囚禁，钱德勒等人在机场看到了被炸毁的飞机后，他们还没来得及说什么彭的手下就追了上来准备击杀他们，狼开着车载着钱德勒跟萨莎一边与彭的手下激战一边逃离了他们的追击。美国圣路易斯市，外交部长告诉了几人在越南发生的事情以及周边国家重要的领导人都被袭击了。卡拉告诉了总统内森詹姆斯号已经驶出了越南范围正在海上等候他们的下一步命令，但是他们并不知道失踪的迈克等人发生了什么事情。一艘货船上，被劫持的船员们都被带到了上面。海盗们态度恶劣的将舰长迈克跟船员们关进了一个牢房里。在夜店被袭击的时候，船员梅森被海盗开枪打中了腹部，但是在现在这个情况下就算有同伴医生的帮忙也没办法处理他的伤口，几人愤怒的跟海盗要钳子纱布等东西，但是冷血的海盗又怎会听从他们的话。钱德勒三人开着车顺利逃出了彭手下老虎的的追击

钱德勒亲自带队前往山寨营救船员，在中国南海岸一个无人控制的城市，有一个鱼龙混杂的山寨，也正是海盗们的栖息地。被袭击的迈克等船员被海盗带到了这个地方，由于这个地方的特殊性，甚至连政府都没办法管辖这个地区，因此海军部长钱德勒等人在内森詹姆斯号上商量了一番后，决定前往营救自己的船员。在海盗的山寨，迈克等人被海盗们关了起来，舰长迈克被带到了一个房间内，房间里都是各种手术器材，迈克看到这些后想要反抗，但是还是被海盗控制住了。迎接迈克等人的危机越来越近了。内森詹姆斯号上，钱德勒在跟美国总统米切纳对话，钱德勒告诉了总统是海盗带走了船员等人，钱德勒决定带人前往去营救自己的船员。最后总统同意了他的请求。海盗山寨，迈克被海盗带到了个房间后将他固定在了床上并且将他的血抽了出来。内森詹姆斯号上之前暂时管理詹姆斯号的

为了营救船员内森詹姆斯号陷入鱼雷包围圈，海盗头领建速在公开的视频内播放了他们抓住的船员，并且以船员的性命威胁总统必须下令让在冲绳的两艘军舰调头离开，否则在36小时内他还会继续处决船员，并且他们都知道了梅森已经死亡了。钱德勒等人在内森詹姆斯号上重新看了一遍船员们的视频，钱德勒发现从迈克口中说出的关于他们的编号并不是真的编号，而是经纬度。在山寨里，以建速为首的海盗们还在继续对逃跑的两个船员们进行严厉的拷打。内森詹姆斯号上，外交部长等高官还在商量到底是听从建速的要求撤离军舰或者前去营救船员。钱德勒等人在内森詹姆斯号上根据迈克几人说出的编号得知了他们被关押的地方位于西沙群岛，但是那里大大小小的小岛共有二三十个，想要从中找到山寨的位置十分困难，尽管如此他们还是决定前往。海盗山寨，被关押的迈克等人决定再

内森詹姆斯有惊无险的通过了水雷的海域，内森詹姆斯号在前往山寨的路上不经意间就进入了海盗们布置的水雷海域，钱德勒下命令马上进入Z状态，开启一级战备状态，他们猜测这些水雷肯定是海盗们为了保护山寨设置的障碍。在美国圣路易斯市，总统再次召开了记者会，但是记者雅各布还是不不依不饶的提出关于詹姆斯号发生的事情。海盗山寨，建速得知内森詹姆斯号已经进入了他们的水雷包围圈，他告诉迈克等人今天他们追捕的是更大的猎物就是内森詹姆斯号，迈克跟同伴看到了海盗们今天运来的一枚巨大的鱼雷，他们知道这就是用来对付内森詹姆斯号的。内森詹姆斯号上，经过商量钱德勒决定派几个得力干将带上潜水等装备去海里将阻碍他们前进的水雷一一清除，因为已经有三枚水雷在慢慢向他们的军舰靠近了。狼带着几名船员潜入了海中，很快他们就发现了一个个巨大的水

钱德勒带领队员成功的解救了迈克等人科鲁兹牺牲，海盗山寨里，迈克等人发现了海盗们的动静很不寻常，他们知道这是因为内森詹姆斯号已经接近他们了，因此海盗可能是要转移位置了。军士长要求女轮机长工程师拿着之前偷来的铜丝去发射塔让同伴知道他们的位置。这时海盗们进来让几人都出去干活，女轮机长故意留在最后。海盗山寨，建速的手下户城很不满意他们要躲避美国海军，他希望能跟海军一战，但是建速心系自己妻子的安危并不想冒险留下。因此他安排了迈克等人一起跟他们搬运货物。迈克故意一边走一边你跟户城聊天，女轮机长趁机脱离了队伍，她一边跑一边数数，没多久她就发现了那个信号发射塔，就在女轮机长将铜丝插入的时候，另一边的内森詹姆斯号上的人发现了无线高频段有信号干扰。建速发现了女轮机长不在队伍当中，他马上派人到处寻找她的踪迹，这时

詹姆斯号逃离了中国军舰的追击美国总统杰夫瑞自杀，内森詹姆斯号上，众人都因为克鲁兹的死而沉浸在悲痛之中，尽管他们成功的回到了詹姆斯号上，但是却也因此失去了一个战友。在饭厅里，几人都因为克鲁兹的牺牲久久不能释怀。钱德勒跟迈克等人觉得在他们后方的中国军舰很有可能就躲在之前的海盗岛上。海盗头领建速被关在了内森詹姆斯号上的一个房间内，这时钱德勒来看他并且将他手上的手铐解了下来，钱德勒想从建速的口中得知为什么当时他会知道迈克等人在越南的夜店里。建速并没有告诉他，只是说美国人毒害了他们的国家，钱德勒告诉建速正是他们的水手带去了治愈药，但是建速却说那根本不是治愈药而是毒药。钱德勒说了一句等回到美国，他就会以引发军事战争而受到处罚，建速却不以为然。建速的妻子因为怀孕加上得了疟疾因此她正在船医的治疗下慢慢康复，

新任总统上任钱德勒等人发现治愈药无效的原因，美国圣路易斯市，总统杰夫瑞的自杀令所有人都没有想到。在总统的悼念会上，很多人都来悼念总统，记者雅各布也对此事件进行了报道。白宫里，大家得知副总统奥利弗在前往圣路易斯市的路上。内森詹姆斯号上，船员们升起了美国国旗用来悼念美国总统杰夫瑞。中国主席彭也发表了自己对总统自杀悲痛之情。钱德勒看着假惺惺的彭很是愤怒的想要杀死对方，但是萨莎跟迈克都觉得现在这样做是不明智的。卡拉跟美国高官艾莉森看到了关于副总统奥利弗在圣路易斯市很受民众的爱戴。内森詹姆斯号上，船医跟船员们都在寻找斯科特博士留下的一些重要器材用以研究病毒的变异，他们找到了斯科特博士留下的日记，船医觉得这是个好的开始。京子让萨莎帮她翻译，为了感谢丹尼救了他们母子的性命，京子觉得丹尼是个很有天赋的男人。

里韦拉被杀死艾莉森控制了总统。在越南的一家工厂内，工人们都在忙着制作弹药，原来这就是彭手下的人，他们将可以让治愈药失效的绿色弹药装在了导弹内再发射到各地。就像红流感一样，它降临的悄无声息，所到之处，只要是没有事先已经打了治愈药的人们都会受到感染。几名越南士兵在中越边界遇到了一枚炸弹的袭击，但是炸弹落在了他们的附近却没有爆炸，就在他们以为这是一枚哑弹的时候却发现了空中早已弥漫了一种绿色的雾气。尽管此时疾控中心的人带着治愈药前来，他们渴求得到庇护跟救助，但是为时已晚整个国家都陷入了灭亡的危机，人们都因为治愈药的无效而死去。钱德勒将这些消息告诉了新任的总统。他们知道这些导弹都是从叫帕莱索的小岛发射的，于是在征得了总统的同意后，他们准备前往小岛。美国圣路易斯市，白宫内卡拉找到了技术分析员丹尼斯，并从

卡拉手忙脚乱的准备东西，外面山姆的车已经到了，卡拉把孩子的东西放在车上，眼睁睁的看着样子离开心里飞航不舍。萨沙正在为一群士兵包扎，满屋子受伤的人屋里充满着血腥味，士兵报告梅朗舰长发射的时间到了，梅朗舰长看着对方舰队心里舍不得。斯莱特里舰长接过手中的发射器按了发射按钮，对面的舰队冒起了火光，滚滚地浓烟和昏黄的天色相接。舰队的长官聚在一起商量可行性的办法，部分长官担心众人就这样干等着。信号分析室从中国驱逐舰海龙号上截取了通讯记录，舰长看到后向决定击沉它，但是又担心密码还在船上。众人希望回国，钱德勒舰长认为只要彭还活着就是威胁，安排格林上位组织组织小队去搜索驱逐舰。总统奥利佛上任48小时接受记者现场采访，记者反问他为何要撤销前任总统的制度，奥利佛哑口无言，艾莉森告诉众人奥利佛的目的是建立更强大美好

艾莉森让总统奥利佛把演讲稿背熟，奥利佛认为演讲稿是在宣布毁灭美国，门外监视奥利佛听到屋里的动静走进来查看，奥利佛势单力薄只好屈服。钱德勒发现中国海军驱逐舰在东京湾，彭很可能就在附近，麦莱特里担心贸然向驱逐舰开火会引来第二艘驱逐舰的攻击。钱德勒告诉众人自己的目标是日本档案馆，目前受河南号的保护，捕捉彭德行动分为两方面，眼镜蛇笑对负责东京湾的中国哦驱逐舰河南号，瘫痪战斗信息中心让秃鹫小队，得以在作战部长的智慧下在国家档案馆突击彭。梅朗舰长估计河南号上军备的武器截击区是档案馆四周120公里区域，众人了解任务后开始行动，梅朗主动请求参与任务，钱德勒让他留在船上指挥。卡拉带着雅各布找自己的朋友吉恩.哈克曼警长，突然出现两人袭击他们，幸好逃出来的特克斯.洛兰及时出现久了他们。雅各布把自己在网上看到奥利佛

卡拉带着奥利弗等人一起逃亡，车上播报一则新闻，艾莉森告诉民众前任总统是被奥利佛杀害的，众人成为了通缉犯。卡拉提议到维加斯去，因为那个地方是难民营。总统办公室兰德尔和贝蒂吵架，艾莉森让众人保持冷静，兰德尔担心物资成了大问题，罗伯塔出面解释，艾莉森决定石油问题解决困境。海军上校来到办公室，艾莉森和兰德尔一起启动了内森.詹姆斯号的自毁装置，众人开心几个小时后内森.詹姆斯号就将消失。卡拉等人赶到维加斯，当年的居民鲍勃告诉他们前几天一辆卡车带走了所有的物资，大多数居民跟着物资一起离开了。特克斯洛兰关心鲍勃上一次用餐的时间，鲍勃坦言自己已经三天没进食了，因为自己的腿脚不好所以不能离开。卡拉把身上唯一一关罐头交给他食用，鲍勃认出了总统奥利佛，并提及新闻上哪些不好的报道，奥利佛感到很尴尬。深夜的海面显得特别

钱德勒带着士兵们给难民分发食物，奥利佛鼓励难民们一定要坚强。钱德勒告诉众人曼纽尔非常合作，他把其他几位领导人的住所、习惯和安保细节都坦白了，萨沙发现接近兰德尔很不容易，奥利佛告诉众人兰德尔的弱点就是喝酒，众人认为不仅要除掉另外三个人还要除掉幕后人艾莉森。艾莉森在办公室里接到其他三位领导人的电话，众人都想要接管曼纽尔的地区，艾莉森被他们闹得焦头烂额。众人为了最后一战做准备，内森.詹姆斯号开到了圣地亚哥海岸，萨沙要解决的目标是艾莉森，特罗斯.洛兰的目标是罗伯塔，麦莱特里的目标是威尔逊。钱德勒远程指挥，他告诉众人一旦秃鹫小队看到克洛夫特，大家就开始行动。克洛夫特像往日一样在酒吧里喝酒，秃鹫小队趁他不备将兰德尔打晕。另一边斯莱特里领的猛虎小队也在成功的抓走了威尔逊。可是萨沙和特罗斯.洛兰却并未抓到艾