一起车祸案，梅根发现男人是被人迷昏后放在驾驶座上而后在车祸中死亡。死者所居住的街道表面上很平静，实际上却隐藏着许多秘密。原来，这里盛行“交换夫妻”，于是死者的妻子、情人、情人的丈夫、离了婚又破了产的邻居一一浮出水面。梅根发现社区里的人们不约而同的擦试眼睛，当她把自己的眼泪拿回去做化验时，竟得出了社区存在着有毒物质的结论。

富翁马丁带着现任妻子朱莉及儿女一起狩猎，几声枪响之后，茱莉摔倒在地。马丁因身体原因没有生育能力，茱莉借用同性恋好友帕特里克的精子人工受孕。马丁的前妻和两个已经成年的孩子也可能为财产杀死茱莉。梅根因随心所欲被迫离开这个案子，而她接手的另一个案子，死者正是帕特里克。随着调查的深入，贝克和莫里斯发现了另一个嫌疑人—业务经理、律师艾兰。

正在公园里玩耍的6岁大的男孩诺亚遭人绑架，绑匪在劫持的过程中遭到了诺亚的保姆海伦的誓死抵抗，绑匪开车撞死了海伦后逃跑。之后，绑匪寄来了附有诺亚照片的邮件，索要100万美金。究竟是谁绑架了诺亚呢？是诺亚濒临破产急需套现的父亲？还是海伦有着暴力历史的男友？还是......

疑似吸毒过量致死的亚历克斯被送到停尸房，伊森发现其腹部有个弹孔，在伊森去向梅根汇报的时候，“尸体”不见了。在休息室被找到的亚历克斯说是他的室友保罗向他开的枪。莫里斯和贝克在垃圾车里发现了保罗的尸体。不良分子亚历克斯和优秀的保罗是让人很不能理解的室友组合。在保罗被杀的地方发现了亚历克斯的DNA，是亚历克斯杀死了保罗吗？

皮特冲进火场救出了詹娜，而刚刚帮助詹娜找到父亲丹尼尔的本却被烧死，丹尼尔不愿破坏“完美”的生活，而不愿意与詹娜相认。詹娜因为在火灾中吸入了氰化物而住院，却在医院接受治疗期间被注射了氰化物致死，她同父异母的妹妹艾米丽意外地出现在了监控录像里。梅根发现詹娜头部的伤和本头部的伤是由不同的凶器造成的，这是很不合理的......

死者是名为布林的职业骑士，蕾西发现布林的死不仅仅是个意外，她的马镫被人故意破坏了。布林被害当天正在教导女囚佐伊如何成为兽医助手。布林被害的前一天晚上整晚在马棚里帮助经理布鲁克斯治疗一匹受伤的马，布鲁克斯被发现将老了的马通过改变它们的牙齿做成年轻的马卖给别人。布林的男朋友詹姆斯也是一名骑士，是一名赢不了自己女朋友的骑士。

陶德要搬到加州工作，但蕾西并不愿意，而梅根开始了与探员德里克的约会。一名叫詹克的男人被发现死在一处荒地，梅根在詹克的胸腔发现了一个戒指印，这是优等生联谊会特有的戒指，詹克的父亲也拥有一个，但随即梅根否认了这个猜测，她认为按照死者胸前的戒指痕迹证明，戒面是朝外方向带在手上的，而只有仍在校的学生才会是这种带法。

医药代表艾米被发现死在河里，她的身体里居然没有一点血。梅根在艾米的身体里找到牡蛎，而卖牡蛎的奎恩第一时间没有说出自己是艾米的男友。梅根在艾米的指甲里找到砷，这种元素只在装修中的旧房子出现，果然莫里斯在一所老房子确认了凶发现场。艾米的情人克莱尔医生预约过这房子，他被认为是嫌疑人，可这时梅根发现艾米身上有个有毒的伤口……

医学院多了具名叫杰姬女人的尸体，学生谢恩被定为嫌疑犯。医学院学生多拉充满好奇心，梅根特别给机会让她观摩尸检。尸体后背纹着罗南这个名字，多拉认出这是一个乐队主唱的名字。罗南认出杰姬就是他以前的女友。经过别人的启发，梅根发现杰姬可能在死前不久刚刚生完孩子，而DNA显示罗南正是孩子的亲生父亲，难道一切都是这么水道渠成吗？

沃特赢了五千万彩票，但被发现死在家中。沃特的皮肤中检查到氧化镁，梅根想到了沃特的表弟戴夫，他们以前同在煤矿工作，但戴夫说两人只是吵了一架。沃特的女友贾斯汀因抓伤过沃特也成被怀疑对象。沃特的脊椎里有金属物嵌入，梅根推测是有人用刀刺杀时力道过猛，刀尖卡在了脊椎里，但是贾斯汀不可能有这个力气。梅根锁定了戴夫，但戴夫真的是杀人凶手吗？

新娘梅丽莎坠楼身亡，新郎马克和前男友扎克都是嫌犯人。梅根在婚礼照片中发现伴娘给了梅丽莎阿斯匹林和肉毒杆菌相克的两种药，伴娘解释这是为报复梅丽莎夺走马克，她才这么做的。扎克和梅丽莎父亲被发现案发当天出入过新娘房，但是此前两人都没有承认过。柯蒂斯化验出梅丽莎的指甲里有铃兰花，而当天只有新郎马克戴着铃兰胸花。

一名贩毒者被枪击而死，查理警官突然来到法医办公室，他说出死者真名叫艾迪，是一名卧底警察。艾迪身上发现原始齿粉末，而这来自查理，这说明艾迪很可能在生前打过查理，皮特不相信他的老搭档会杀人。梅根希望调查警局所有人的尿样，这惹恼了整个警局所有的人。梅根发现开枪后的弹道后劲会夹伤真凶的手，她利用警局每个人的签名发现了真正的凶手。

曾被控告杀死自己五岁儿子的希拉里被活埋致死，而当初正是梅根的法官母亲琼判决希拉里无罪释放。梅根经过初步验尸，得出希拉里死前曾遭前夫克雷格性侵，而希拉里生前曾呆过的船里发现了主持人坦普尔的头皮屑。伊森也因舆论导向认为希拉里死有余辜，这触怒了梅根要求尊重死者的原则。伊森将功补过找出了案发现场的轮胎印，而这个胎印来自于希拉里的母亲。

冷库发现了乔的尸体，凶杀工具被确定是打肉锤，皮特和莫里斯根据血迹抓到了亨利。亨利是乔的小舅子，也是商业伙伴。莫里斯认为职员迪莉娅很可能是因为没有升职而杀害老板，而电线中的DNA也指向另一个名叫安娜贝拉的女人。梅根在乔的胃里发现了发霉的香肠，香肠上的细菌应该来自于农场，这下子梅根确定了凶手到底是谁。

凯尔被发现死在陌生人的后备箱中，梅根在死者的身上发现尸蜡，这确定了可能还有另一具尸体没有被发现。莫里斯调查得知凯尔早就被老板布兰德解雇，但他却一直没有告诉妻子。凯尔曾为业主泰迪装修过房子，莫里斯和梅根在房子的墙里发现了一具女性尸体。尸体叫莉莎，她是泰迪的女性友人。泰迪在装修过程中人在外地，那么到底是谁杀害莉莎的呢？

珠宝商迈克夫妇被儿子格雷格发现死在家里，梅根发现妻子罗宾的捆绑伤痕很轻，这说明凶手并不想伤害罗宾。暗恋罗宾的迈克合伙人欧文成了怀疑目标。警方在房子里发现了迈克大儿子艾伦的DNA，艾伦解释迈克经常对家人施暴，他虽然恨父亲，但不会痛下杀手。凯特在格雷格身上发现和罗宾一样的红疹，格雷格的好友特拉维斯进入到警方的视线。

唐娜被送往医院时就被宣布死亡，而卡莉心脏中枪正昏迷中。梅根发现唐娜和卡莉的身份其实被调包，真正的死者是卡莉。莫里斯经过调查发现卡莉最近一直饱受被跟踪的困扰，而唐娜研究所里的同学苏斯则成了怀疑对象，因为她一直忌恨于唐娜拿到了奖学金。唐娜的母亲交给梅根一个唐娜为卡莉保存的盒子，在里面梅根发现凶手的真菌指纹。

运尸员达尼被马塞尔下药后神志不清被车撞死，皮特愤怒中打了马塞尔，马塞尔突然病发。费城医院突然爆发与马塞尔一样症状的病人，梅根意识到城里发生了传染病，法医工作处被进行安全隔离。莫里斯收到一则恐怖录像，事件被升级到恐怖袭击。凯特在检验中不小心刺破了头指，她面临着感染的危险。

费城死亡的人数仍在上升，凯特病发晕倒，就连梅根也束手无措。联邦特工提出一个构想，也许恐怖份子就在这些感染者中。莫里斯在抓捕恐怖份子时发现了病毒血样，疾控中心主管斯塔福德认出这种病毒叫做马尔堡，目前没有方法医治，梅根认为可以用初步研究出的疫苗在病发者身上做试验。

一名叫尼基的女大学生被人割喉咙掏大脑，梅根想起珍妮弗的案子手法也是如此，令人震惊的是尼基竟然是珍妮弗的女儿。梅根去找杀害珍尼弗的威尔森寻找线索，对方说自己是清白的，他要求梅根向他道歉。尼基的同学杰克、为威尔森写传的丹尼尔以及威尔森的女儿苏菲亚都成了怀疑对象。这时威尔森越狱，梅根被其绑架，皮特为救根梅身中一刀命在旦夕……（逝者之证第二季大结局）