为美国国务院工作的会计师Jason遭人谋杀,杰斐逊学院团队介入调查.他们发现死者的遗骸隐藏在一家旅馆楼顶的空调机组内,要想取出来非常困难，除非把空调机组整体拉走!唯一能将它移下来的方法是...降落伞?无论如何,Hodgins和Daisy将在这起案件中联手奉献他们的智慧。

商业顾问AdamPak遭谋杀,尸骸被山猫吃得所剩无几,这种案件只有杰斐逊学院团队才能处理.有证据显示一处专为夫妇开办的静修度假场所大有可疑,于是Brennan和Booth决定假扮夫妇到那里从事卧底调查,搜集更多证据.他们在静修度假地遇到了另一对已婚夫妇BillSchumacher和EvelynSchumacher,他们的感情看起来有点太完美了。

「EstrellasLocas」帮派成员JamieDelcampo遭谋杀，他的遗骸出现在一辆被烧焦的汽车里，杰斐逊学院团队介入调查。与此同时，Pelant最近针对杰斐逊学院团队的攻击令Sweets萌生倦意，他宣布自己将暂时离队，「清理自己的思绪」。他来到某中心担任志愿者，发现一个孩子竟然是某个「EstrellasLocas」帮派成员的儿子。虽然他不想插手案件调查工作，但还是放不下Booth和Brennan这帮人，最终决定帮助他们。

Pelant回来了，杰斐逊学院团队对他恨之入骨，发誓这一次要彻底终结他的恐怖行径，将他打入十八层地狱。一具尸体即将被运到杰斐逊学院供研究之用，调查组想出一个对付Pelant的计划。在特别探员HayesFlynn的帮助下，他们对这具尸体动了手脚，使之看起来完全吻合Pelant的作案手法。然后他们通过大肆宣传该案来抢Pelant的风头，诱使他主动现身。但Pelant总是能领先他们一步，他们的计划造成了灾难性的后果，一名与Booth十分亲密的人惨遭他的毒手。与此同时，Sweets回到团队中，他坚称Flynn探员隐瞒了秘密——他不是每个人想象中的那种好人，他们不能完全信任他。

某高中校长遭人谋杀，杰斐逊学院团队在调查中发现他患有末期癌症。他生前创办了一家网站，上传了一些非常鼓舞人心的视频，但是访客必须付钱才能观看这些视频。调查组发现其中一段视频非常可疑，前终极格斗锦标赛（UFC）重量级冠军ChuckLiddell（自己扮演自己）在视频中被Charlie打了脸。这条线索让调查组顺藤摸瓜找到了Charlie的遗愿清单，并最终让他们侦破了案件。与此同时，Brennan和Booth终于开始策划久违的婚礼。Sweets可能被一套虚拟分析系统取代……他面临下岗的危险！

布兹在婚礼彩排进行时接到通知，参议院大楼附近发现了一具年代久远的女尸。为了让布伦南专心准备婚礼，所有的实习生齐聚杰斐逊，但每个人都打赌婚礼会被临时取消。即将举行婚礼的教堂发生火灾，安吉拉为好友策划了一场紧急婚礼。实习生们成功破了谋杀案，他们一同去参加这场爱的仪式。布兹与布伦南终于如愿以偿结为连理，两人的爱情有了一个新的开始。

布兹满心欢喜在阿根廷享受蜜月，却被布伦南带去参观停尸房，更因此参与了一起命案的调查。死者的身份确认为90岁的老人豪特，诸多证据显示豪特曾是一名纳粹。布伦南和佩雷兹医生合作对尸骨进行研究，分享者影视，她们查出死者是被金条击打致死。布兹与瓦伦萨探员逮捕了死者年轻貌美的妻子，但布伦南提出质疑。证据确凿之下，佩雷兹承认她才是凶手，而死者是她的爷爷。命案终破，而布兹和布伦南在阿根廷继续甜蜜蜜月。

两个学生在海狸坝上发现了一句损毁严重的尸体，死者肖恩生前曾是一名精子捐献者，而他用假学历欺骗了所有受捐献者。肖恩虽被解雇但仍继续捐精，并通过与精子银行的经理朱蒂丝发生关系获得客户。温德尔通过研究骨头发现了死因，分享者影视哈金森模拟伤口找到了凶器，朱蒂丝遗留在死者伤口里的指甲暴露了她的罪行。哈金森痴迷于研究昆虫，他成功在自己的颈部孵化了一只肤蝇。

著名球星基德曼杀妻案开庭审讯，布伦南作为陪审员被隔离。杰斐逊接手了一具被冲上海岸的残骸，死者正是基德曼案的证人巴恩斯。布伦南虽坚持基德曼就是凶手，但却因证据不足，基德曼被判无罪释放。布伦南对证据进行了细致分析，终于查出是基德曼和妹妹艾莉森联手将巴恩斯杀害，基德曼在确凿证据下终于伏法。安吉拉在网络上追踪到了盗取凯姆身份之人，凯姆意外发现此人是自己的旧友。

一名饮食科学家遇害身亡，其遗体被凶手送进一台绞肉机，混进了一批炖肉罐头。一所学校的学生在食堂里吃到了这种罐头，所有人都感觉非常恶心……杰斐逊学院团队在调查中发现，这名科学家最新的饮食发明成果能为他带来巨大的经济利益。或许在这个价值数百万美元的食品工业中，充满嫉妒心的竞争对手杀害了他？调查组决定沿着这条思路收集证据。与此同时，Angela计划为从未参加过单身女郎聚会的Brennan举办一次婚后单身女郎聚会。她们玩得很疯……疯到无法收场的地步！

雨夜的闪电将一具尸体炸得粉碎，尸体残骸和碎片被一起带回杰斐逊。死者的身份是年仅16岁的学生阿曼达，布兹和布伦南前去找她的父亲沃特斯博士和体操学校的教练了解情况。布兹怀疑是沃特斯弑杀亲女，布伦南却相信沃特斯是无辜的。布伦南重新对骨头进行检查，痕迹显示阿曼达是被人勒死，证据显示阿曼达生前的好友蕾切尔才是真凶。哈莉因盗用身份被警察逮捕，凯姆最终决定不起诉这个前任好友。

一个装着女性尸骨的神秘包裹寄到了布伦南家里，她将尸骨带去杰斐逊进行分析。死者拉娜死于1995年，她曾因架帆船出海环游世界而轰动一时。布伦南无法摆脱博朗的阴影，她坚信幽灵杀手仍逍遥法外，并且拉娜就是第一位受害者。哈金斯去拜访了拉娜生前的男友特伦特，随后竟收到特伦特畏罪自杀的消息。爱迪生博士接手研究幽灵凶手的案件，布伦南挣扎许久终于打消执念放心交与他负责。

绿化带中躺着一具几乎完全腐烂的尸体无人知晓，直至被动物挖出警方才收到报案。死者科林是一位消沉的独立音乐人，他生前并不知道自己的音乐已风靡菲律宾。斯维茨发现了科林生前写的一首情歌，布兹立刻将科林的情感发展作为线索展开调查，真凶最终被抓捕归案。温德尔和布兹打冰球时手臂骨折，布伦南从他的X光片中发现他患有骨癌，温德尔得知这个噩耗后几经挣扎，最终他决定积极与病魔抗争。

杰斐逊被送来一具在猪食槽发现的遗骸，足部法医费尔默作为实习生为布伦南帮忙。死者艾伯特生前热衷且擅长于国际象棋，斯维茨前往象棋俱乐部进行调查，他的线索助布兹找到了案发现场。安琪拉还原了谋杀发生时的场景，斯维茨通过一盘象棋比赛找出嫌疑人蒂姆，并说服布兹让他独自审讯，在斯维茨的心理战术下蒂姆终于认罪。凯姆被科学月刊选为年度杰出女科学家，她要求安琪拉和布伦南与自己一同获称。

绑匪把劳伦的尸体深埋在公园的泥土中，尸骨遭到了强碱的损毁。布兹向劳伦的父亲和继母宣布了噩耗，没想到他们又收到了绑匪索要赎金的信息。安琪拉追踪到短信是从劳伦的手机发出，她分析了劳伦发出的照片，真相终于大白。劳伦自己策划了这场绑架，却因意外丧生，并欲嫁祸给深爱她的男人。哈金斯惊悉自己有位从未谋面并患有精神疾病的哥哥杰弗里，杰弗里因无钱治疗将被转院，哈金斯决定向银行贷款帮助哥哥。

海湾码头的湖中浮起一具裹在袋子中的腐尸，经证实死者莎莉是CIA招募的线人。布兹和丹尼一起调查此案，但嫌疑颇深的罪犯易卜拉欣却在多年前的一场爆炸中生死未卜。安琪拉确认了凶器，布兹认出这是尼克的匕首，但尼克却称莎莉是自己所爱之人。凯姆查出莎莉是被遗弃脱水致死，当年的监狱看守易卜拉欣的约翰内森才是真凶。约翰内森供出易卜拉欣手下的信息后被轻松赦免，不甘的布兹和尼克最终将他送上军事法庭。

化粪池中的尸体身份得到确认，死者本尼曾因偷窃入狱而刚刚被刑满释放。国务卿介绍来一位新的实习生富恩特斯博士，他自大的态度让布伦南非常不满。哈金斯发现的证据帮助确认了本尼生前开的肇事车辆，布伦南推断车上当时还有第二人的存在。安琪拉通过录音机中的芯片恢复了其中的录音，乔治娅面对斯维茨的审讯坚持自己无罪。布伦南发现车祸不止本尼在车祸中受伤，于是她和布兹设局调查，原来真凶就是富勒警官。

电视节目制作人乔被残杀，他的尸体在公路上被发现时已长满野葛。乔生前在节目中扮演“胡萝卜比尔”，布兹和斯维茨分别调查了他的新搭档杰克、疯狂粉丝沃克和代替乔扮演胡萝卜的汤米。经过对证据的仔细分析，真凶沃克难逃法网。布兹希望能为女儿举办一场热闹的生日会，布伦南在父亲的劝说下最终同意了布兹的计划。同事们并不认可克拉克的第一部悬疑小说，没想到克拉克向他们宣布了小说即将出版的消息。

布兹夫妇在托德的葬礼上惊见托德本人从屋内走出，于是布伦南把不明死者的骨灰带回杰斐逊，却没想到一个骨灰盒中装入了三组骨灰。死者的真实身份是托德的私人管理员丹尼尔，而杀人凶器竟是一个古老珍贵的艺术品。对火化炉中组织的毒理检验证实托德和丹尼尔是毒友关系，托德在布兹的审问下承认强杀丹尼尔，但最终证据表明真凶是托德的女友梅斯勒。米歇尔向芬恩主动承认劈腿行为，芬恩痛苦同意分手。

瀑布国家公园中藏着一具尸骨，安琪拉使用新进的三维全息模拟技术还原出死者艾比的容貌。艾比生前患有严重的红斑狼疮，她通过服用印度大麻缓解疼痛。癌症治疗颇有进展的温德尔回到杰斐逊，他却因化疗期间服用大麻违反规定而被解雇。艾比生前在伯克医生的药房工作，她却暗中在此销售自己种植的大麻。在查出凶器后真凶浮出水面，大学生亚当难逃法律的制裁。在布兹的帮助下，温德尔重新获得工作且有了自己的办公室。

有居民沼泽地里发现了一具尸体，但杰斐逊的科学家们却无法准确判断死亡时间。死者玛德琳为了治疗女儿的疾病接触到了“冷冻新星”，她死后因被低温冷冻导致内脏破裂。布伦南与布兹前后调查了冷冻师沃肖还有冷冻新星的诺亚与其妻子，但一系列证据都指向诺亚。原来诺亚一直暗恋着玛德琳，他在玛德琳死后甚至将她冷冻企图能得到她的心。阿莱斯都带凯姆见了父母，母子二人终于解开心结。

又发生了一起与幽灵杀手有关的命案，布伦南很快就确认死者是麦克纳马拉家族唯一的幸存者斯蒂芬妮。布兹迫使美国证劵交易委员会配合调查，布伦南发现M家族的园丁是斯蒂芬妮父亲贾尔斯的私生女，而斯蒂芬妮就是那名幽灵杀手。随着这条线索的曝光，一起20年前的谋杀案浮出水面。凯斯勒当年被贾尔斯嫁祸入狱服刑，他出狱后展开报复行动。布兹救下了企图自杀的凯斯勒并将他逮捕，布兹获得上司的举荐得到升职的机会。

布兹忙于准备考试，斯维茨代替他到现场调查井底发现的男尸。安琪拉在失踪人口中找到线索，死者为43岁的游泳教练布莱恩。布伦南调查了布莱恩的学生与同事，她意外发现布莱恩夜间在变装酒吧上班，更是酒吧的变装红人。新来的实习生沃伦常在实验室讨论敏感话题，她对斯维茨表现出明显的好感。沃伦敏锐的观察力破了命案，布莱恩的学生昆汀就是凶手，他自己在行凶时受的伤成了破案的证据。

布兹接到匿名电话约他相谈有关麦克纳马拉家族之事，对方却突然死于房车爆炸事件。房车中到处都是破碎的骸骨与皮肉，凯姆在现场发现了福斯特藏在乳环上的芯片。福斯特口中残留的DNA显示凶手是三名三角洲特种部队人员，并对死者实施了酷刑。布兹再过会面试中被议员哈德利反咬一口，安琪拉查出哈德利也是受人威胁，事态愈加严重，布兹在家中做好准备等待凶手出现。布兹在枪战中受伤，却反被控杀死了前去逮捕他的FBI探员。