Booth蒙冤入狱，Brennan和杰斐逊学院团队竭尽全力帮助他逃过此劫。但是要想让Booth顺利出狱，他们首先要洗清他的罪名并查清这起案件背后的真相。导致Booth入狱的案件与政府阴谋密切相关，而一具16年前死亡的尸骸有可能成为破解迷局的关键。与此同时，Booth在监狱里的日子很不好过。即便他能够出狱，他还将面对一个政治野心很大的FBI探员（John Boyd）的挑战。在等待审判的过程中，Booth意识到他所在的监狱里关押了许多他亲手逮捕的罪犯，危险无处不在。另一方面，众人惊讶地发现Daisy怀上了Sweets的孩子！

为了揪出陷害Booth的幕后黑手，杰斐逊学院团队在特别探员James Aubrey的帮助下继续调查这起联邦政府历史上最大的阴谋案。有证据显示，这起阴谋可以一直追溯到J. Edgar Hoover（现代联邦调查局的创始人）时代。调查组在先前一名受害人的身上发现了与这起丑闻有关的DNA证据，这使得他们成功缩小了嫌疑人名单，或许案件真相很快将大白于天下。Lance Sweets在首集中不幸遇害，第二集将重点描述杰斐逊学院团队的所有成员如何表达内心的悲痛之情（当然，也包括Daisy）。「他们将以自己的方式举行葬礼。」即便是在这种令人伤心的时刻，该剧仍然保留了黑色幽默。终有一天，Booth会恢复元气，重新变回那个幽默的、爱唠叨的自我。但是在那之前，他和Brennan必须以最痛苦的方式向Christin

在实习助手Rodolfo Fuentes（Ignacio Serricchio）的帮助下，杰斐逊学院团队开始调查一名有争议的保守派电台主持人的谋杀案——他的遗骸被人抛弃在一条雨水沟里。调查组通过调查受害人的「业余活动」发现了一些惊人的证据，这使得他们很快缩小了嫌疑人的范围。与此同时，特别探员James Aubrey（John Boyd）竭尽全力赢得Booth的信任。Brennan担心最近发生的一系列事情会影响Booth的心理健康。

Aubrey探员帮助杰斐逊学院团队调查一名视频游戏设计师的谋杀案，受害人的遗体被河水冲上了岸。他们发现受害人的事业给他带来了丰厚的报酬，他积累了一笔不小的财富，每一个和他关系亲密的人都有可能是嫌疑人。他们随后又发现受害人正在别人身上玩自己的「游戏」，调查方向出现令人惊讶的转折。与此同时，实习助手Jessica Warren向杰斐逊学院团队谈起她参与的一个教育项目，所有人都很感兴趣。Brennan和Booth讨论Christine的未来。「Mommy says size is determined genetically.」——看起来Christine继承了母亲的优点？她更像Brennan而不是Booth？

杰斐逊学院团队参加一个法医科学大会，Brennan将发表主题演讲（Cam、Hodgins和Angela陪同前往）。这原本是件轻松的差事，但……他们在大会现场的楼梯井里发现了一具人体遗骸！许多参加法医大会的专家都想提供帮助，有些人则趁机推销产品。证据显示Hodgins是嫌疑人之一，杰斐逊学院团队不得不尽快想办法证明他的清白。与此同时，Brennan偶遇自己在出版界的主要竞争对手Tess Brown（Nora Dunn）。实习助手Wendell Bray（Michael Grant Terry）回到杰斐逊学院团队中，他称自己的癌症有了新变化。倒霉的Hodgins，这是他第二次被人怀疑是凶手了！

识骨寻踪第十季06亚裔女佣明容被害，她的男友宋德朴杀了明容有虐待癖的父亲逃至美国，明容为了寻找男友而来却受骗被贩卖。布兹深入调查查获了人口贩子维克多的老窝，受害的多名亚裔女性讲述了自己家人被威胁的经历。明容的雇主因贩卖人口被捕，被贩卖的塔米为了不被明容拖累无奈将其杀死。阿莱斯都的论文没有通过，凯姆试图帮他向布伦南说情。阿莱斯都对于凯姆逃避婚姻和保护自己的行为不满，两人解开心结重归于好。17:05中介牟利贩人口亚裔女性遭囚禁20:52悲惨女人诉辛酸人贩威胁伤亲人35:17憎恨死者连累人塔米护女杀明容

一个旋转木马下惊现一具严重损毁的人体遗骸，杰斐逊学院团队开始调查一家拥有数十亿资产的对冲基金公司。在极其复杂的调查程序中，杰斐逊学院团队发现受害人是这家公司的对冲基金交易员，其老板（Gill Bellows）有重大作案嫌疑。然而他们很快又发现受害人与一些罪证存在关联，案情发生转折。与此同时，Aubrey在调查过程中倾注了私人感情，使得他们的调查变得越来越困难（幸亏Booth承担起「哥哥照顾弟弟」的责任！Booth曾经看过Aubrey的档案，他知道Aubrey过去的遭遇……）。Christine第一次开口骂人，引发了Booth和Brennan的争论。

著名字谜大师劳伦斯横尸水坑，遗骸被坑中的酸液严重腐蚀。即将临盆的黛茜回归实验室，她沉迷于助产师瓦伦缇娜的虚幻言论中。布兹对其他字谜游戏玩家进行调查，黛茜则发现劳伦斯生前已患上老年痴呆，劳伦斯的助理趁老板患病之际偷他的钱帮自己还赌债。黛茜羊水突然破裂被送入产房，她在紧急关头将所有线索联系起来帮助布兹抓住了真凶。劳伦斯的儿子埃默里归案，斯维茨和黛茜的孩子终于顺利出生。21:01创作字谜遭窃取室友愤怒发恐吓30:32老板身患痴呆症助理偷钱还赌债32:22黛茜诞下遗腹子生产过程趣事多37:55不知大师患重病真凶失手弑亲父

心理学教授兰德尔的遗骸被发现丢弃在各处的垃圾箱中，布兹被困在网络交规课中无法脱身，于是布伦南与奥布里组成了搭档。受害人生前对他的学生进行了倍受争议的实验，其中一个学生因此性情大变。哈金斯的自制实验确定了死亡时间，奥布里很快就找出了作案凶器。调查过后真凶终于落网，作案原因却是误杀。布雷在治疗中对一名护士产生好感，他因顾虑自己的癌症而十分矛盾。14:42绣球花吸血变色哈金斯献身命案27:03艺术雕塑成凶器昔日情人变嫌犯40:08爱鸟毒猫误杀人真凶肢解抛尸块

本集为全剧第200集，具有重要的标志性意义。男主角David Boreanaz担任本集的导演。本集从某种意义上来说是个特别集，故事将向著名恐怖电影大师希区柯克致敬。换句话说，本集将讲述一个「虚构」的「幻想故事」——在上世纪五十年代的好莱坞世界里，我们熟悉的杰斐逊学院团队和FBI调查组是什么模样？Brennan成了一名洛杉矶警署命案侦探，必须面对当时警察队伍中严重的性别歧视问题。Booth成了臭名昭著的珠宝大盗。Booth被人诬陷谋杀了一名富有的交际花，他必须和Brennan合作洗清自己的罪名，同时尽快找到真正的凶手。

工人在公园伐树却意外发现一具尸体，死者嘉斯汀的父亲透露女儿生前以做灵媒为生。奥布里和布兹找到了嘉斯汀的客户艾拉娜，艾拉娜坦白自己与死者曾为情侣关系。奥布里审问女房东时得知她曾与嘉斯汀发生争执致其头部受伤，艾拉娜的无心之举却导致嘉斯汀死亡。安琪拉对灵媒朋友阿瓦隆的能力深信不疑，她极力说服哈金斯打消了对阿瓦隆的偏见，阿瓦隆在斯维茨的车里找到了他生前为布兹准备的礼物。11:02江湖骗子装高深假意通灵遭戏弄22:00灵媒头部受重创拄拐父亲惹怀疑29:59同性情人起纷争房东吃醋怒出手35:03情人惊恐埋尸体原本无罪变有罪

FOX电视台表示这一季很可能是该剧的最终季。经过十个季度的磨合，骨头姐和Booth步入了婚姻的殿堂。 贝伦博士是一位法医人类学家，是一名年轻的刑事人类学家兼小说家，她拥有不同于凡人的特殊才能，就是能根据受害者的尸骨，分析寻获常人难以发现的线索，因此，FBI联邦调查局特别借重她的专长，协助警方侦破一些因尸体严重腐烂、烧毁或被破坏而使得普通的尸检方法无能为力的凶杀案件。各种罕见怪异且内幕重重的刑案，等待贝伦博士抽丝剥茧，还原真相！影迷们可在剧情发展中，看出编剧企图将两人塑造成当年X档案的男女主角。

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泰勒在树林中发现了高中生莫莉的尸体，泰勒因吸毒被警方拘捕。布兹和奥布里来到莫莉的学校调查，他们发现成绩优异但性格孤僻的莫莉一直以来遭受语言暴力的折磨。尸骨上的伤痕证实凶器是一把剪刀，一切证据都指向了莫莉的三名女同学。警方发现莫莉的裸照和电话被人放在了网上，经查证竟是泰勒所为。莫莉的日记中显示她有抑郁和自杀倾向，语言暴力和同学排挤把她推向了死亡的边缘，莫莉最终选择自杀以让其他女孩受到惩罚。

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瑜伽教练迈卡遇害后被凶手拖到树林里纵火毁尸，他和女友楠一直保持着开放性的恋爱关系，双方各有情人并互相知晓，警方调查后排除了双方情人的嫌疑。迈卡死前曾见了刚刚假释出狱的朋友戴尔，身无分文的戴尔提出向迈卡借钱。迈卡欲将自己和女友的所有积蓄借给戴尔，谁料女友极力反对失手将他打死。哈金斯夫妇打算辞职搬去巴黎生活，而布伦南也挽留戒赌顺利的丈夫在家居住。

IT男霍尔特遭人谋杀，布兹怀疑案件与勃朗有关，布伦南从尸骨上的刀痕处判断凶手在刻意模仿勃朗。勃朗将偷走哈金斯的46亿存在邓洛普公司却凭空消失，警方认为是几名黑客之间为了争夺钱引发了血案。哈金斯在霍尔特家中的披萨盒上检测出了弹药残留，布伦南和实习生通过披萨店的监控录像找出了真凶。奥布里在抓捕行动中屡遭电击，莉拉逃脱无门最终落入法网。安琪拉和哈金斯回心转意，布伦南和布兹决定辞职开始新生活。