当第五季开始时，距离上一季结尾已经过去三年时间。亚瑟王的统治已经牢固，格温纳维尔王后和圆桌武士团成为他坚强的后盾，卡美洛城从此进入一个全新的黄金时代。在卡美洛城繁荣发展之际，毁灭的种子也在黑暗之中悄然萌芽。在北方的冰冻土地上，一些人离奇失踪，没有留下任何痕迹。接到当地居民的求援报告后，亚瑟王决定亲自带领梅林及他的骑士前去调查事件真相。在未知的领域中，潜藏的危险正等候他们到来。

关于莫德雷德（Mordred）的古老预言给梅林带来沉重的心理负担——因为他无法改变亚瑟选择的道路。冰原迎来了黎明，但梅林和亚瑟都已经筋疲力尽。伴随着艰难的脚步，Ismere堡垒越来越近了，但梅林的恐惧感也越来越强烈。莫德雷德究竟在玩什么把戏？莫甘娜和德鲁伊Ruadan（LiamCunningham）究竟在Ismere堡垒的地窖里寻找什么秘密？那东西有什么强大的力量？这一次，即便是梅林也无法阻止亚瑟落入虎口。只有一件事可以肯定：阿尔比恩大陆将面临前所未有的巨大危机。

亚瑟跟梅林在外面救了一个差点被人判死刑的女巫，女巫给了亚瑟一个号角，这个号角可以让亚瑟进入冥界入口召唤出一个鬼魂。亚瑟不顾梅林的劝阻去召唤了他父亲，乌瑟指责亚瑟无视等级把卡梅洛特治理得偏离了轨道。亚瑟激烈争辩。道别后乌瑟叫了亚瑟的名字，亚瑟在离开前回头看了一眼，而这一眼释放了乌瑟的灵魂。于是乌瑟的灵魂回卡梅洛特城去伤害平民出生的骑士（小帕可怜负伤）和格温（平民皇后orz），最后亚瑟只能下定决心把乌瑟遣回冥界。盖乌斯给了瑟梅一种喝下去后可以看见鬼魂的药剂，乌瑟弄昏了亚瑟后梅林出来使用魔法对抗。乌瑟最后把梅子逼到绝路，眼看梅子就要被杀了，亚瑟醒来后赶过来，乌瑟看见亚瑟要救梅林，赶紧说“梅林是一个——”但是“魔法师”三个字还没说出来，亚瑟就吹响号角把他送回去了。又是一次身份差点被揭穿却奇迹般地没被

莫佳娜伙同奥丁平了米希安公主老家，抓了她老爹威胁她把亚瑟带来。莫佳娜用魔法老化成米希安的仆人希尔德，跟她一起去卡梅洛特。莫佳娜逼迫米希安谎称要去救她负伤走不动的老爹而把亚瑟带往陷阱。期间梅子怀疑希尔德有问题，公主把莫佳娜的名字写在溪边的石头上让梅林去发现，可惜看到名字的梅林还没跑回去先被莫佳娜伤了醒不过来，亚瑟一行人只好先走，米希安难过地看着梅林，莫佳娜警告她。后来盖乌斯偷偷用魔法让梅林醒过来，梅林和高文马上赶去就亚瑟一行人。高文放暗箭去救骑士团，梅林去救亚瑟和公主，还用魔法把莫佳娜打晕了（莫姐居然还不知道梅林有魔法），半路上奥丁追到亚瑟，一对一单挑，奥丁败，亚瑟原想杀了奥丁为父报仇，但在梅林的劝说下亚瑟提出签署和平协议，奥丁最终接受了。最后大家都平安，米希安老爹也拿回了国土。

三面女神派人对亚瑟下了审判，去三面女神的洞里质问的时候“女神”（真的是年纪很大了）的审判。在洞口，梅林让亚瑟卸下武器，说这边是圣地，亚瑟没理他。在洞里，一言不合，女神要伤亚瑟，小莫替他挨下，被抬回卡梅洛特城。亚瑟为了救小莫去向三面女神请求，三面女神说必须恢复旧教（就是魔法重回大地），否则维持原判，不会同意亚瑟的请求。晚上两个人在洞口露宿，亚瑟惊讶于梅林能感受到这地方圣地的气息。亚瑟问梅林要不要同意恢复旧教，梅林知道小莫以后会和亚瑟同归于尽，不能让三面女神去救回小莫，于是居然在亚瑟有所动摇的时候跟他说“卡梅洛特不能有魔法的存在”（就是这段！在心里默默诅咒BJ一千遍！）。第二天亚瑟向三面女神表明决定，回去以后惊讶地发现小莫居然好了！梅林伤心地望着把小莫抱起来的亚瑟，在楼上跟盖乌斯说自己太是很傻了

格温在郊外骑马散心的时候被莫佳娜带到黑暗之塔，亚瑟一行人去救她。在塔里，莫佳娜用曼德拉根一步步控制格温的灵魂。梅林用魔法给众人带路，到了黑暗之塔，格温的弟弟伊兰第一个冲上去，被房间里的原本莫佳娜准备用来刺死亚瑟的剑刺死了。格温伤心欲绝，至此，灵魂完全交托给了莫佳娜。众人带格温回去，火化伊兰。

亚瑟、梅林、格温在外面骑马散心，突然前面爆炸了一个小包，亚瑟被马甩下来，遇到个杀手，KO了他，回去以后把在马夫家里搜到破坏马鞍的线，可怜的马夫下了狱。娘娘晚上去杀了马夫，到郊外跟莫佳娜汇报。莫佳娜把一种会让人死得很痛苦的毒药交给格温，格温下在亚瑟的酒杯里，把梅林下了狱。梅林晚上逃出来，用魔法救亚瑟，再原路返回去（可怜的娃来去都是爬城墙T.T），亚瑟醒过来把梅林放出来，说他暗杀的智商不够，绝对跟他没关系。最后格温把毒药的制造者抓了起来了案。

虚伪皇后小正太大晚上来找梅林，给他看德鲁伊人的标记，梅林同意跟他去theValleyoftheFallenKings救他妹妹。同时阿玛塔的国王来访，格温听从莫佳娜的建议联合这个国王要杀亚瑟。在郊外，梅林处处照顾可怜的男孩。后来发现男孩不是德鲁伊，莫佳娜把梅林弄晕。男孩良心发现，照顾梅林知道他醒过来，按他说的药方帮他采药治疗。回去的路上被一伙强盗包围，梅林用魔法击退强盗，男孩佩服梅林在亚瑟身边任劳任怨心怀理想。。回去的时候两国国王正在签字，楼上阿玛塔国王的一个杀手正在用箭瞄准亚瑟。梅林用魔法，杀手射偏，阿玛塔的国王被射死，随即杀手转过来射梅林，结果男孩被射中死了。

真心真意这集亚瑟发现格温不对劲，盖乌斯说她的灵魂被女祭司控制，要到一个XX湖去洗白。但是要一个魔法师念咒语，亚瑟说他不相信巫师，盖乌斯说这次绝对靠谱，因为他找了个女的（梅林那个不敢置信的眼神==盖乌斯让他自己想办法）。格温被药迷晕，带出去。半路上梅子摔下悬崖，亚瑟下去救他结果被压在石头下。小莫在瑟梅遇险的时候及时赶到。后来小龙艾苏萨过来喷火，亚瑟先走，梅林用龙语，莫佳娜又过来，小莫昏倒，梅子自己先逃。小莫醒过来对抗莫姐，莫姐昏倒。赶到湖边，正好看到老梅林扮了个女装在那边念咒语洗白格温，对亚瑟说“你觉不觉得她有点眼熟？”最后格温洗白，亚瑟既往不咎，感情好得很==小莫对梅子表示梅子这样默默付出只为了将来英国统一魔法重见天日让他很钦佩。

莫嘉娜抓了阿雷陀要逼他说出Emrys是谁。阿雷陀的仆人芬娜千辛万苦去找梅林要给他预言。但是盖乌斯不相信芬娜，在他们第二次会面前报告了有一个巫师在郊外。梅林只好让芬娜逃走。最后梅林找到芬娜，但是芬娜之前送给阿雷陀的信被莫佳娜看到，莫佳娜的人找到了他们。芬娜为了保护梅林牺牲了。梅林成功逃走，盖乌斯读出芬娜给他们的预言，说剑栏之战会是亚瑟王的终结。

骑士们发现有人残暴屠戮，小莫追上一个人影，发现是自己的青梅竹马，放走了她，被梅林看见。后来那个女孩被亚瑟找到时企图杀亚瑟，拒不承认自己有罪。反控亚瑟有罪。小莫求情没有成功，决定劫狱，半路上女孩杀了士兵，小莫惊异。最后两人被逮到，亚瑟把小莫关进监狱，经梅林劝说下给女孩机会，但是女孩拒不认罪，亚瑟只好绞死她。小莫悲痛欲绝，逃狱。梅林很难过，小莫到底弃明投暗。小莫去投奔莫佳娜，说出梅林就是Emrys。莫佳娜向卡梅洛特下战书。

莫佳娜找来一种可以吸魔力的蛇。梅林和亚瑟在酒馆赌钱之后回去，被蛇吸走魔力。莫佳娜进攻，高文在混战中救起一个女孩，剑栏之战在即。梅林心神不宁，决定前往魔力起源地水晶洞，向亚瑟请假，亚瑟说他曾以为梅林很勇敢，但是他现在觉得自己错了（梅子痛苦的表情T.T）。去水晶洞的路上，梅子请高文暂时陪同（没了魔力的梅子有点胆小嘿嘿）。高文对女孩无话不说，但她却是莫佳娜的人，莫佳娜掌握了梅子的去向去堵他。梅子在洞口让高文赶快回去帮助亚瑟，只身进洞。梅子还是在莫佳娜以为他的路已经给她封死了之后还是找到了水晶洞。在洞里，他老爸的灵魂现身，指引他找回魔力。梅林透过水晶看到莫佳娜的计划并传达给睡梦中的亚瑟。亚瑟随即醒来，马上备战。众人战得精疲力竭时梅林回到战场，用几下闪电帮助亚瑟锁定战局。最后亚瑟在战场中寻找还活着的士

国王失踪，卡梅洛特城里，众人心急如焚。大家发现女孩卧底身份，格温判她死刑，并从盖乌斯那里知道了梅林是魔法师，在护送亚瑟，表示对梅林的感激，十分开心。高文很悲伤，带上小帕找莫佳娜复仇，莫佳娜从高文嘴里逼出亚瑟的真正去向，高文含恨而终。莫佳娜追上瑟梅，梅林杀了她，草地上，亚瑟对梅林说了一句“Thankyou.”之后翘了T.T。梅林召来腐龙，腐龙说他已经做不了什么了，说英格兰再次出现巨大危机的时候亚瑟会回来，因为他是“theonceandfutureking”.梅林把亚瑟的剑投向湖中，湖中伸出一只手接住剑沉下去。痛心送走亚瑟，梅林等待千年，而小帕回去报丧，格温做了女王。