八重从小就像男孩子一样十分淘气,喜欢一切新奇的事物。恰逢少主大人回乡,八重对到来的部队心生神往。八重见到哥哥高超的枪法十分敬佩,她向父亲提出了要学枪的想法,但是遭到了父亲的反对,父亲认为女孩子还是传统一点的好。。
八重已经十七岁了,周遭的女孩也陆续谈定婚事,唯独八重还八字没一撇。井伊遭水户暗杀后,幕府一片讨伐水户藩的声音,唯有容保力排众议,认为此时国内不该发生内乱,因此改变了幕府的决定。
时尾对八重说出了自己的小心思,即为大藏大人的婚礼表示伤心,因为时尾深深喜欢着大藏大人。在京都号称天诛的斩杀事件不断,让负责治安的会津藩士焦头烂额。为了快速增加人手,会津藩接收了壬生浪士组。
象山认为孝明天皇若颁布开国敕令,攘夷激进派的人甚至可能向皇宫开炮,于是想请天皇移居彦根城。没想到象山在回家途中就遭刺客被杀害,而长州军也如象山所预料,前来包围京都。
幕府诸藩组成军队讨伐长州,但萨摩的西乡在问过胜海舟后恍然大悟,认为日本不应再陷入内乱,于是提提议劝长州归顺,也避开了一场厮杀。尚之助在完成新式洋枪的制作之后,鼓起勇气想八重求婚,而八重终于答应了。
将军家茂过世后,庆喜继任德川宗家,却迟迟不愿继承将军之位,而且说要征讨长州,却又出尔反尔取消出征,让众人人十分气愤。容保原打算在庆喜继任将军之后便返回会津,没想到孝明天皇却突然病逝。
觉马奉藩命前往长崎买新式洋枪,并接受眼疾的治疗。觉马在长崎被宣告将失明,心急的觉马为了在失明前买到有用的洋抢,甚至与德国商人起了冲突。后来冷静下来,才慢慢与外国人成为朋友,并谈成了洋抢的交易。
尚之助担心会津的安危,与八重一同去探勘白河等地。而就在萨摩与长洲正积极想打倒幕府之际,土佐却献策给庆喜,希望庆喜将政权奉还给朝廷,以免遭讨伐。而庆喜为了保存德川家,打算将大政奉还。
庆喜接受土佐的献策,决定将大政奉还于朝廷。但西乡拿着诛杀庆喜及容保的秘密文件,率三千大军进驻京都。胆怯的庆喜称病不去参加第一次诸侯会议,结果会议决定贬降庆喜官位一等,并没收一半领地。
王政复古之后,林权助和佐川官兵等人极力阻止打算撤离京都,前往大阪的庆喜,但遭到神保修理劝阻,最后只好同行。在此同时,会津的八重开始和藩里的女眷们,缝制祈求胜利的旗帜。
八重见嫂子闷闷不乐便邀请大嫂练习挥刀,在此偶遇到了雪夫人,八重的大嫂受到了启发,于是开始积极的面对生活。会津表达归顺之意却不被接受,政府军执意要攻打会津。奥羽诸藩为了拯救会津,而加深结盟关系。因暗杀世良修藏为契机,终于成立三十一藩组成的奥羽越列藩同盟。
八重指导孩子们锻炼体力以及枪术知识,大家都对八重刮目相看。赖母新政府军进军到奥州街道,西乡再度主张归顺,可是却不被大家接受,而且还被容保解下白河总督职务。后来力抗新政府军的二本松藩被攻陷,奥羽越藩同盟快要崩毁,而危机也渐渐逼近会津。
八重拒绝加入长刀队,她认为守护会津的不是长刀而是枪支。新政府军陆续攻下东北诸藩,以势如破竹的气势逼近会津城下,八重与母亲等人也进入城内。为了替弟弟报仇以及保护会津,八重穿上军服,背着枪枝进城,并且自告奋勇要率领步枪队作战。
二叶夫人和孩子走散,悲痛万分的她在大敌当前的时候不得不选择坚强。为了守住会津,将军们商议良策却无果,官兵誓死抵抗但却因敌人武器太过强大而伤亡惨重,会津局势不妙。
八重一家对于尚之助写给八重的休书一事很担忧并认为其中必定有隐情,然而八重则坦然接受休妻这件事情,选择离开。山川大人发现斗南拨款只有七千石,并安抚民众想办法解决民众的生存问题。
八重和母亲佐久带着阿峰前来京都投靠觉马。八重到京都之后,得知觉马正在建设京都,觉马告诉八重,知识就是力量。八重不断地学习新知,还听从觉马的安排,前往女子的教育机构任教。
京都在觉马的构想和槙村的裁决下,逐渐要步上文明开化的轨道时,槙村却受到藩阀门争的牵连而遭逮捕。八重与觉马奔赴东京去营救槙村,却意外得知尚之助的下落。原来尚之助和觉马离婚是迫不得已的。
新岛襄从美国回到久别10年的日本,希望创建基督教的学校,却四处碰壁。在木户的建议下,襄来到京都,并前去拜托觉马帮忙。在觉马的协助下,槙村答应让襄建校,还说要帮襄介绍八重。
新岛襄说出了自己向八重求婚的事情,大家感到很惊讶。为斗南置办米粮而遭诈骗的尚之助,独自拦下责任而面临4年的诉讼,但还未等到结果便因肺炎辞世,让八重悲伤不已。在襄的开导下,八重终于接受了事实。
明治维新后虽然成立新政府,但士族们却因此失去职业,并对政府的弃之不顾深感不满。就在士族们的怨气无处宣泄,濒临爆发之际,西乡带领士族举兵,政府因此宣布讨伐西乡的命令。
西南战争结束后,襄的同志社女子学校成立起来,这里来了一群一心想追求学问的年轻女学生,这让重视礼仪的美国老师伤透脑筋。其中一名来自萨摩女学生阿律,因为父亲死于戊辰战争,因而敌视来自会津的八重。
政府对接受美国基督教会资金的同志社进行打压,在襄的奔走和努力下,终于逃过废校一劫。但在众教师的抗议下,为了挤出教室和师资,来设立传教士培训班,襄公布了拼班的决定,这引起了学生们的不满。
板垣退助所掀起的自由民权浪潮,慢慢的向日本全国扩散,这让政府十分头痛。而京都的槙村无视政府议会的存在,强行执行追加征税,觉马决定借助于舆论的力量来惩治槙村的蛮横行为。
板垣退助在演讲后遭刺杀,襄去探望板垣,并请求板垣支持他设立私立大学。襄听板垣说起当年会津之战时,村民们冷眼旁观武士们奋战,若日本的国民也是如此,将来日本势必灭亡。这件事让襄决定带着曾经在会津奋战的八重与阿峰重返会津。
由于政府要排除私校的征兵免除特权,襄急于将同志社改建为大学,于是决定去欧美国家筹集资金。这期间女子学校的美籍老师与八重发生冲突,但是八重决心捍卫襄所创立的学校。
就在襄尽全力去筹募资金开设大学之际,传教过却决定不再支援女子学校,八重决定亲自奔走筹措资金。但这时候更加雪上加霜的是,觉马的妻子时荣竟然传出与觉马门下的书生私通的传闻。
八重为了筹措成立大学的资金,不惜拖着患有心脏病的身体到东京去参加募款集会。操劳让襄的身体状况更是雪上加霜,最后医生终于告诉八重,襄的心脏随时可能会发生无力回天的状况。
襄到东京去筹措成立大学的资金,但身体状况却持续恶化,而迟迟未归。八重得知消息后探望襄,并替襄送了终。襄过世后,八重非常悲伤,为了让八重振作起来,觉马要八重去东京参加红十字会的活动。
觉马以同志社的校长名义鼓励毕业生成为弱者的护卫,促进和平反对战争。而浩想要为会津洗刷污名,坚持要完成《京都守议职始末》一书。觉马对此提出当年会津应该有回避战争的道路可走,并健次郎发生了争执。
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